Basic Information
Symbol
hsa_PHKA2_0005100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0140034
hsa_circPHKA2_019
hsa-PHKA2_0006
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18928990-18956867
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18910872-18938749
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-360.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-382.80 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
450.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(.(((((....).)))).)..)(((((.......)))..(((((.....)))))...(((((((.((((((((..(((..........(((((((.(.(((((((((((.((((...((((.((.............)).))))((((((....(((((((.(((((....(((((((..(((((((((....(((((..(((........)))..)))))...)).))))........(((.(((((((.(.(((....((((((((..(.((((((....)))))))..))))))))....))).))).)))))))))))..)))))))))))).)))))))......)))))).....((((........)))).........((((((.((.((.((((((..(((((((((..................(((((...((((........(((((((.((((.((...))..)))).)))))))..)))))))))...((((..((.(((((((((((((((......((.(((((.((..((((.((((.(((((((.(((....)))..))))...))).)))).))))...))))))).)))))))))))))))))))...((((((.((((((...(((((((.((....((((((...(((((......(((......)))......)))))))))))..))...))))))).......((((..(((.(((.((((((.(((....)))....)))...)))))).)))..))))(((........))).((((((...((((((((((.((((..(((........)))..)).)))))))))).....))...))))))..)))))).))))))..((((((((..((((.((((.(((......(((.((((...((((.((((((.(((((..............)))))...)).)))).))))(((((...))))).))))))).....))).))))))))..))))))))...))))...........))))))))))))))))).)).))))))..............))))))))))))))).)))))))).........))).))))))))((((((......))))))((((.....))))..(((.(((.((((((((..((..(((((((..((..(((..((((...))))......))).))..))))))))).))))).....))))))..)))........(((((.....)))))......))))))).......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,(.{,,(,{.,.{{|||}.,.,|(((((,.,,,{.,||,,((({(...,,|}}}},{,(((((((,(({(({{{.|{({.,........{|||{{{,{,((({{{{{{{{,{||{|{{({((|{(,.,....{{{{,.|(({{{(({(((,...}||.||||,|||,,,..|{|{,,{,.|.|||{||}}||||((({(,,(((...,,,,.}},,}))})}||,,|||}.......|||||.{{{{({{({..{{{|,..,((((((((((((.......{(((((,,,..,|({{((.((((((((((|{({{{,{{(({{{((,,,,))))))),.})))))....,,}}}}},.....{{{|||{{,,,.{{(((((....{{({((((.({,{,,....,|,|{(({{{.,,.,}}))),.,.))))),,)),,,.}}}}}}}.......(((((((.((((.(,...,)..)))).))))))).......||||.,,,)))).((.((((((((((((((((.,{{,.,.,|||{.((..{{,,,((((,,,,((((.(((....)))..))))}}}))).})))})|||{,.,,))))).,)))))))))))))))))).,,,,,,,...........(((((((.{{,,,,((((((...(((((......(((......)))......)))))))))))..)).,,))))))).....}}}|}}..,.)))}})))))))))))....))))))..)))))))))))}.}|,,}}}|||,}}......,,|}|||,,,,||,||||,,|||}||||}.{{(........}}}..,},}|}})})}}}|(((((((.....)))))))}....|||||...({{(((((,,((((.({((.(((..,,,.({(.{(((.,.{{{{.({{{|,.{{||{,,,}.,,,,,,}}}}}}}}...}}.)))),))))(((((...})))),))})))}..,,,))}.))))}))),,)})))}}}...}}}|,..{{{{{...{.,..,.,...))))}............,,,.,,}}}}...)))}))))))))}))|))))))))}}}}..,,,})}.})}}|||,((((((......)))))),|||.....)}}},,{((,(((,{,,,{{||}}||,.{((((((.,((..(((..((((...)))).....,))).)).,))))))}}}.}}})).....}}}}}}..,},....,,,,(((((.....)))))......)))}))),,.....})
Forensic Context
No forensic context available.