Basic Information

Symbol
hsa_PHKA2_0006600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0090009 hsa_circPHKA2_015
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18942499-18956867 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18924381-18938749 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-223.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -239.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 284.81
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......))....((((......((.(((((.((..(((((((((....((((..(((((((.((((.(.((...((((.(((((......)))))..))))..((.((((((((((.((.(((....((((.......(((((.(((((((....(((((((.(((((....(((((((..(((((((((....(((((..(((........)))..)))))...)).))))........(((.(((((((.(.(((....((((((((..(.((((((....)))))))..))))))))....))).))).)))))))))))..)))))))))))).)))))))......)))))......((((........)))).((((....))))...((((......))))((((((.....))))))..........(((((...((((........(((((((.((((.((...))..)))).)))))))..)))))))))..)))))))((.(((((((((((((((......((.(((((.((..((((.((((.(((((((.(((....)))..))))...))).)))).))))...))))))).)))))))))))))))))))......................))))))))).)))))))))).))))).))))))).)).))..))))....)))))).)))..)).)).))).)).......((((..(((.(((.((((((.(((....)))....)))...)))))).)))..)))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(({,.{{.,,.((({{,,.,{{{{{({({{({{..{{{{((({{...{{||,,|,{||||,{{{{,|||||,,{||{.{{{{{......}}}}}}}))},,||||||||||||||,{{.(({,...,,,,}},....|(((({{(|(((....}||,||||.|)},.}}.}})}.}}.{{.((((((,{({(((({.,{{(((...((((....)))).),||.,|||,....,..|||||,.|||||.,...}}}}}},{((((((((((((.......{(((((,,,..,|{||((.((((((({{{|{{|||,{|({{{{((|||,))))))),,})))))....,,}}}}},.....{{{{{{{{.,..{|(((((....{{||{{{{.({,,.,....,|,|((({{{.,,..})))),...}}}}}.,||,,,.}}}|||}.......(((((((.((((.(,...,)..)))).)))))))..,,,,,||||..,.)))),((.((((((((((((((((.,{{,.,.,|||{.((..{{,,,((((,,,,((((.(((....)))..))))}}}))).})))})|||{,.,,))))).,)))))))))))))))))).,,,,,,,...........{{{({{{.||||.|{(((({...{({{{..,,,.(((.....,)))..,...)))))))))))..)).}}))))})).....,,}|||..,.))}||}))))))))))....)))})}..)))))))))))},))..)))))).))...
Forensic Context

No forensic context available.