Basic Information
Symbol
hsa_PHKA2_0007700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0140039
hsa_circPHKA2_012
hsa-PHKA2_0004
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18954173-18959793
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18936055-18941675
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-99.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-109.66 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
91.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((((((((.(((.....((((((((..((....))..))))))))(((......)))........((((((.((....)).).))))).........(((((((((((.((((((..((((...)))).......(((.((.((((((.((((.(((((((((((.(((.(........).))).))).))))........)))).)))))))))).)).))).(((((.....(((((.....)))))..)))))........)))))).)))).))))))))))))))))......((((.(((((.(((((((((((.(....((.(...(((((((.(((....))).)))).))).....).)).....).))).)))))))).....)).)))))))..))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({{,,(((({{((({{,(({,.,{{((((((((..((....))..))))))))(((......)))..,,...,{{{{{,,|{,,,.)),),)))))}.,,.....,((((((((((.((((({..(({,...,}}}.......(((,((.((((({{((((.(((((((((((.(((.{........}.))).))).))))........)))).)))))))))),)).))).(({((.{{,.(((({.....}}))).,))))},}}.,,.,)))))).)))))))})))))))))))),,.....((((.(((((.(((((((((((.(....((,,...(((((((.(((....))).)))).))).....)})}.,...}.))).)))))))).....)).)))))))..,,..,.
Forensic Context
No forensic context available.