Basic Information
Symbol
hsa_PHKA2_0008600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0140041
hsa_circPHKA2_003
hsa-PHKA2_0043
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18963196-18972530
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18945078-18954412
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-178.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-189.12 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
129.60
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((.(((..((((..((.((..((((((..((..(((((((.((((((........))))))..)))))))((((......))))))..)))))).....))..))..)))).))).)))).)))...(((((...((((((((((...(((...((.(((((((.(((((((.((((.(((((((.(((.((.((((.(((((((...((((..............))))....((....(((....)))....))..............(((((((((((.((.((((.(....).)))).))..)))))....))))))..))))))).)))).))....)))..))))...))).))))(((...)))...))))))).)))))))..))((((((....))))))......((((((((((..(((((.(((.((.......)).)))..)))))..((((....))))))))))))))....((.(((...))).))......))).)))).))))))..)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((.(((,,((({..{|,||},((((((..({..(((((((.((((((........))))))..)))))))((((......))))}}..)))))),,...||..},..))}}.))).)))).))),..((((,,..((((((((((...(((...,,.(((((((.(((((((.((((.(((((((.(((.((.((((.(((((((...{(((,.......,.....}}}}..|.{(....{((...,))),,,{,|,..{{......{{{(((((,{,,,{.,|}||||}|....}.})}}.)),,))}}}|,..}))))}..))))))).)))).}}.,,.)))..))))...))).))))(((...)))...))))))).))))))},{||((((((.,,,|||}}|.,{{..(((((({{{,.,({{||.,{(|{(.,.,...)),)))..))))}..||||||,,||}}}}}))}}})}.,..||.|||}.,))),.,.,,,..))).))))}})))))..)))))..,
Forensic Context
No forensic context available.