Basic Information

Symbol
hsa_PHKA2_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PHKA2_0036
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18912322-18938319 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18894204-18920201 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-609.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -637.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 400.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))..((...((((((((..((((.((((.(((......(((.((((...((((.((((((.(((((..............)))))...)).)))).))))(((((...))))).))))))).....))).))))))))..))))))))...((((....(((((((((...(((.....((.(((((........(((((((((...........(((((((((((((((((((.(((((.((.(((((...((((((......))))))((((.....))))...(((((((......)))))))..((((((..((..(((..((((...))))......))).))..)))))).......))))).((((............))))(((((.....)))))....((((((((.......((((((..((((.((((((((..(((..(((((((.(((((((....))))).(((((.......((((((((((((...)).)))))).)))))))))......(((((...)))))....(((((((...)))))))(((((....))))).....)))))))))....)))))))))))..)))).))))))...((((((((((.(((((((((.((((....((..(((.(((((((((...........)))))))))))).))......(((.(((.(((.....)))))).))))).)).))))))...)))..)).))))))))..((.((((((((....(((((((((((......))))((.((.((((......)))).)).)).....(((......)))((((((((((((((((((((((((((((((.(((.((((((((((((((((.....)))))).((((((.((((...))))(((((((((.(((((.........))))).......((((.(((((((((..((((((......)))).))..))))))).)).))))..)))))))))...(((((.((((......))))..)))))))))))...)))))))))).((((.......))))....((....(((((............)))))...))((((((((..............(((((((.......)))))))(((((.((....(((.......)))..)).)))))...........))))))))............)))...))))))..)))))))))).((((.......)))).(((...)))((.....)).((((.....((((((....)).))))....))))....)))).))))))))))..(((.((((.......)))).)))..........)))))))..)))))))).)))))))))).))))))).)))).)))))))))).)))))((((((((...))))))))..)))))))))((((......))))....(((.(((((((.((((.((.(((..((((((((.((((((((......)))).))))....((((((.(((..((....))))))))).))....(((((........)))))((((((((.....)))..)))))((((((...)))))).(((((((......(((.((....))))).....)))))))))))))))...)))))))))..))))))))))))))).))))).))).)))))))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,...,}|.,({...((((((((..{(((.((((.(((......(((.((((...((((.(((({{.(((((...........,,,)))))...,,.)))).))))(((((...))))).))))))).....))).))))))))..))))))))...(((({...{((((((((...(((.....((.(((((........(((((((((...........(((((((((((((((((((.(((({{((.,{,.({{.((((((......)))))).|||.....|}||..,((,((({,,,,,,||}}||}.{((((((.,((..(((..((((...))))......))).)).,))))))},}.,,,)},,..,||||,,..,}}....|||,({{((..,..)))}|.,{,((((((({...,{,.,(((((..((((.((((((({..(({,.(((((((.({(({({.,,,|}||}.{((((....,..(((((((((({{...,}.))))))}}}))}}}}},.....(((({...)))))....,{{{{||,,,))}}}))(((((....))))).....}))))))))...,)}}})))))))..)))).)))))),},((((((((((.(((((((((.(({{,...{{..(((.{((((((((...........))))))))}))).}}......(((.(((,(({,,...}))))),)})}},)),))))))...}}},.)).)))))))),{((.((((((((....(((((((({((......})))|{.((.((({......)))).)).)}.....(((......)))((((((((((((((((((((((((((((((.(({.((((((((((((((((.....)))))).{{{(((,((((...}}}|(((((((({.,{|||.,,,,,...}}||}....,,.((((.(((((((((..((((((......)))).))..))))))).)).))))..}}}}}}})),|,{{{{{.{{{{.,,...)))),,))}}})))))}...)))))))))).((((.......))))....,,....(((((............)))))...},((((((((..............(((((((.......)))))))(((((.((..,,({,......,)}}..)).)))))...........))))))))............}}}...))))))..)))))))))).((((.......)))),(((...}}}{{,,,,.}}.((((.....((((((....)).))))....))))....)))).))))))))))..{({.(((({......}})),))}........,,))))))),.)))))))).)))))))))).)}))))).)))).)))))))))).)))))((((((((...))))))))..))))))))){(((......)))}....(({,(((((((.((((.((.(((..((((((((.((((((((......)))).))))....((((((.(({{,.,....,}))))))).})...,((((({{..,..{|||||(((((,,{{{{,,|||,.}}})}((((((...)))))}.||||||{..}}}}|{{.||}.}}))},).....))))))))))))))).}.)))))))))..))))))))))))))).}}))).))).)))))))))).))..
Forensic Context

No forensic context available.