Basic Information

Symbol
hsa_PHKA2_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PHKA2_0028
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
X:18920192-18920686 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18902074-18902568 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-256.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -262.03 kcal/mol
Frequency: 0.0001
Diversity: 55.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.((..(((.((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((((.(((((((.((...................)).)))))........)).))))).)))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))..)).))))))))((((((......(((..(((((((((((.....................((((((((((.(((.(((....)))))))))..)))))))..((((.(.((((.....)))).).))))..)))))))).)))))).((((((((.....(((....((((((..((((.(((((.....)))))))))...................)))))).)))..))))))))))))((.((((...((((((((....))))))))...)))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((.((..(((.((.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((.((((((((((((((((((((.(((((.(({{((,,(,...,.{{{{{.....}}}}),.})}})....,,..)).))))).)))))))))))))))))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))).)).)))..)).))))))))((,(((......(({.,(((((((((((.....................(((((((,({,(({.(((....)))}}))}}.,))))))){.((((.(.((({.....}))).).)))),.)))))))).)))))).((((((((.....(((....((((((..(((,{(((((.....)))))))))...................)))))).)))..)))))))))))|((.((((,..((((((((....)))))))).,.)))).)),))
Forensic Context

No forensic context available.