Basic Information

Symbol
hsa_PHKA2_0007000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PHKA2_0023
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
X:18942671-18943785 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18924553-18925667 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-351.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -372.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 216.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((....(((((((.....(((.(.(((......))).))))..(((((((((((.....(((((((((((..((((.(((....))))))))))))).......)))))............((((.((.(((((.(((..........))).))))).)).))))...((((((.(.(((((((((((..(((.((((((((.(((((.........)))))))))).....(((((((((((((((...(((....)))...(((((((.((((((.....((((((((....)))...)))))...(((((((...(((((.((((........((((...))))..((((((((....(((.........))).......((((((((((((.....(((((....((((((...))))))....))))).)))))..))))))).(((((...))))).(((....)))..)))))))).....)))).))).))....)))))))((((((......))))))......))))))))))))).....((((.((.((((.((((....)))).)))).))))))....((((((((.....))))))))........)))))))))))))))......))).))))))))).)).))))))))))...((((((((......))))))))...)))))))))))(((.((((.((((....)))).)))).))).....((((..(((...)))..))))....))))))).))..(((((((((((((((.((((..............(((((...((((((.((((....)))).))))))((((.((...)).)))).((((((((((((.((((...(((.(....).)))((((((......))))))(((((.(.((((...(((((((..........((((((...((((.(.(((((......))))).)))))....))).))).........)))))))..)))).).))))))))).))))))))))))........)))))......((((((.......)))))).))))))))))))).......))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((,,,,(((({((.....(((.,.{{{......}}),})))..{((((((((((.....,{,,,((((((..{(((.(((....))))))})))))).,,....|}}}.,,|.....,,..((((.((.(((((.(((..........))).))))).)).))))...((((((((.(((((((((((..{(({((,(((((.(((((.,.....,.)))))))))).....(((((((((((((((...(((....)))...(((((({{((((((.....((((((({....}))...)))))...((((((({({(.((,.((((({...})))))...}))))}|((((((((....(((.........))).......((((((((((((,....{((((....((((((...))))))....)))))}),))),.})))))).((((,...})))).(((....)))..)))))))),.{{,|,||{|}}.,)}},.))))))}((((((......))))))......)))))))))))))|,||.((((.((.((((.((((....)))).)))).)))))),,..((((((((.....))))))))........}))))))))))))))......}}).))))))))).)).))))))))))...((((((((......))))))))...)))))))))))((({(,,,.,,,|}}}}},,,..,,|,|.......{|||..,{,,.,}}}..}))}....))))))),)},.((((((((((((((((((((......,,,.,{,.(((((..,{{(((|.{{{{....,))).})))}}|{||,||.,.||,|}}}.((((((((((((.((((,..(((.{....}.)))((((((......)))))){((((.(.((((...(((((((..,,..,...((((((...((((.,.(((((......))))).,))))..}.))).)))....}}...)))))))..)))).).))))))))).))))))))))))........}}}}}.,,,..((((((.......)))))).))))))))))))).......))).))),
Forensic Context

No forensic context available.