Basic Information
Symbol
hsa_PHKA2_0008500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PHKA2_0050
Host gene
PHKA2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
X:18961828-18969390
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
X:18943710-18951272
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-129.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-136.85 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
110.11
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((..(.(((....((((...........))))....(((....)))...((((........(((((((.((...))...)))))))))))....))).)..))))))((...(((((.((((((((((((((.(((((((((((.....(((.((((......(((((..(.((((............)))).)..))))).....(((..((((((.....))).)))..)))........))))))).....)))))..))))).).)))))............((.(((((((((.(((....)))..))))..)).))).))..(((((..(.((((...((((((....((..(((((.(((...))).))))).))...))))))..)))).)..)))))....))))).).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((..(.(((....(({{...........|,||....(((....))),..{||,..,,......((((((((........))))))))}},.,..))).)..))))))((...(((((.((((((((((((((,,((((((((((,{{,,,,(,,{,{,{{{|{{|||,..,,{.,,.....,,{.....,})})|||||,||.{{.(((..((((((.....))).)))..)))..,.....))))))}.,,}}))}}}}}))))))).)))),..,},.......((.(((((((((.(((....)))..))))..))},)).))..(((((..(.((((.,.((((((....{{,.(((((.(((...))).})))).),...))))))..)))).)..))))),}}.))))).).))))))))))
Forensic Context
No forensic context available.