Basic Information
Symbol
hsa_chr1_0162100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PIP5K1A_0060
Host gene
PIP5K1A
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:151190338-151191231
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:151217862-151218755
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-394.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-408.06 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
154.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((..((((((((((.(((((((...((.((((((((((((((((..((...(((.(((((((((((((((((((((((.((((((.((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((((((.((((((((((((((((.(((.(((....((((((((((((...((((.(((...((....))..)))))))....)))).))))).)))..((((....))))...........(((((...)))))((((..((((.....(((((.......)))))....((((.....))))(((((((((((...(((((((...))))))).((((.(((((.............)))))...))))....))))))))))).........(((((((((((((((................))))....((((((.....(((.((((((...))))))..)))...))))))((((..(((...)))...)))))))))))))))...(((....(((((..((((((((......))))).)))....)))))...)))))))....))))....(((((...((..((((((......))))))..))..)))))......))).))).)))))))))))))))).))))))).)))))..)))))))))....))))))))))))))..)))).)))))..)).)))))).))))))))))))))))))))))).)))))..)))))))))))))))).))...))))))).)))))))))).))))))).)))).))).))))))))))))))))))))))))((........).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((((..((((((((((.(((((((...((.((((((((((((((((..((...(((.(((((((((((((((((((((((.((((((.((..(((((.(((((((((((((((((((((((((((.(((((.(((((((.((((((((((((((((.(((.(((....,{,{((((((((...((((.(((...,,....,}..))))))}...,)))}.))))}.)}}..((({....))))...........,{{((...)))}|((((..((((...{(({{({{{{...{{{({..(((((((............)))))))..})))),}||}}})))||||.,(((.((((({{{(({.{{....)).))},}),,)))))).))),})))).........((((((((((((,{{..,.............||}|....(((({{.,,,.{{,.{{||||,..}})}}}..,,}.},))))))|||,..(((...))).,,.,,))))))))))))...(((,,,,(({{{..||||||||,.....})))}.}}}....}}))),..}}}))))....}))),.,,,,,,....||..{(((({......})))))..,,....,,,......))).))).)))))))))))))))).))))))).)))))..))))))))),...})))))))))))))..)))).)))))..)).)))))).))))))))))))))))))))))).)))))..)))))))))))))))).))...))))))).)))))))))).))))))).)))).))).))))))))))))))))))))))))((,.....,,).)
Forensic Context
No forensic context available.