Basic Information

Symbol
hsa_PIP5K1A_0002600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PIP5K1A_0067
Host gene
PIP5K1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:151196721-151212515 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:151224245-151240039 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-359.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -386.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 368.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.(((((.........((((((((((((((((((...((((.((.....)).))))...))))))..))))))..(((((...)))))(((.............))).......((((((.((((...))))...))))))..............(((((((.(((.(..((((((((((.(((((((....(((((...)))))..)))).((((((((((.(((((((((((((..(((.(((((.......((((..(((((...((((((((.(..(...(((((...((((.((..((.((((((((((((((((....)))......((.(((..(.((((((((.(((((((....(((((.(((..((((..((......))..)))).))))))))....(((((...)))))..(((((((.....(.(((((.(..((((.........))))..)))))).).....)))))))......((((((((((........((((((((..((((.((...(((.....(((............)))....)))....))))))..)).))))))........)))))))).))))).)).)).)))))))).)..)))..))))))))))))))).))...(((((((......)))))))...(((((...))))).......(((.....)))......)))))).)))))....)..).)))))))).))))).))))....(((((((..((..(((....)))..))......)))))))))))).)))..)))))...).)))))))(((((......))))).......))))))))))...(((((((.......((((.(((((.((((((.((((((((.........)))..)).))).))))))..........(((...))).((..(((((....))).))..)).((((........))))))))).))))...((.((((.....)))).)).)))))))))).)))))))))).).))).)))))))....)))))).(((....))))))))...))..((((((.(((((((.(((((...((((((.....(((........))).........))))))))))).))))).))..(((((.(((.(((...(((((.(((((...))))).)).)))...)))))))))))(((((........)))))((((..((((......))))....)))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..{,.(((((..((..(((((({{.{,..,|}},}})}}}|}}..}},}|..(({.{{{{..,,.{({.(((((((..(((((...)))))(((.,,.......,,.))}.......((((((.((((...)))).,.))))))..............(((((((.(((.{..((((((((((.(((,(((.,,.(((,,..,|||||{{||||((((((((({{.(((((((((((((..(((.(((({.......((((..(((((...((((((((,,..,...((({{,..{{{{.{{..{(.(((((((((((((,,...,,{{{....,..,,.((((((((((((,..((((((.{((({((((((((..((((((((((.......(((({,(((.......))))))))))))..)}}.,,))}..)))))))))))}.)))))).......,,|.,,.,{{{....)))},,}}}}.,,,,....{(((((((((........(((((({{..{{{(,((...|||,.{,.(((.,.{.....|,.}}).}..}))...,))})))..}}.))))))........)))))))).))..}.)))}})))))}})),),.,...,,,))))))))))))).}}...(((((((......)))))))...(((({...})))).{{,...|||,}}..}},......))}))),}}}}}.....,.}.)))))))).))))).))))....{((((((.,(,..{{{....}}}..,,.,,,..))))))}})))).)))..))))}...}.,))))))(((((.,...,}))||,....,.))}))))))),))},}}|||......{(((((((((..,,,,,|.})},}})))}}.,,,,,},},.||,,,,.||||||,.,,,..}}.{{{...}}}.||,,||||{.,..})),},.....|({{..,.....)))}}||},.,})),}}||.((((.....))))))).}},))),))).)))))))))).}.))).))))))).....,||||((,....}})))),.,,,.{(((((.((({....}))).)))))),,,))))))).))}...,{,,..,|{{{{{,,,..))}}}))),|||||||{.,,,.{(({((((({(((...(((((.(((((...))))).)).))).,.))))))))))}{{{{{....,,,,))))){{|,..((({......}}}}....})))).))).}
Forensic Context

No forensic context available.