Basic Information

Symbol
hsa_PIP5K1A_0002700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PIP5K1A_0084
Host gene
PIP5K1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:151196721-151219441 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:151224245-151246965 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-461.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -493.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 432.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))......(((((((.(((((..((((((....(((((((((((..((..(((.....((.((((((...((((((...))))))..))))))))......(((((....((((((.((((...))))...))))))..............(((((((.(((.(..((((((((((.(((((((....(((((...)))))..)))).((((((((((.(((((((((((((..(((.(((((.......((((..(((((...((((((((.(..(...(((((...((((.((..((.((((((((((((((((....)))......((.(((..(.((((((((.(((((((....(((((.(((..((((..((......))..)))).))))))))....(((((...)))))..(((((((.....(.(((((.(..((((.........))))..)))))).).....)))))))......((((((((((........((((((((..((((.((...(((.....(((............)))....)))....))))))..)).))))))........)))))))).))))).)).)).)))))))).)..)))..))))))))))))))).))...(((((((......)))))))...(((((...))))).......(((.....)))......)))))).)))))....)..).)))))))).))))).))))....(((((((..((..(((....)))..))......)))))))))))).)))..)))))...).)))))))(((((......))))).......))))))))))...(((((((.......((((.(((((.((((((.((((((((.........)))..)).))).))))))..........(((...))).((..(((((....))).))..)).((((........))))))))).))))...((.((((.....)))).)).)))))))))).)))))))))).).))).)))))))((....))))))).(((......)))......((((((((.(((((((((((((.....((.((.((((((..((...........))..)))))))).)))))))))....(((((.(((.(((...(((((.(((((...))))).)).)))...)))))))))))(((((........)))))((((..((((......))))....))))........)))))))))))))).....)))..)).))))))))..)))...))))))...(((((....(((....))))))))...........))))).)))))))(((((((...........((((.(((...(((((.(((((.((..(((.(((((..((((....((((.((...)).)))).(((((....)))))...))))))))).))).))))))).))).))...)))..))))((((....)))).((((((((((..(((.....((((......))))....)))......))))))))))...)))).)))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...))),.....(((((((.(((((...((((({{{,(,..,,,||||,|||,.||,...,,,({((((.(({{,(((((...)))))|{{,,...|||,..,.{{{{,.....((((((.((((...)))).,.))))))..............(((((((.(((.{..((((((((((.(((,(((.,,.(((,,..,|||||{{||||(((((((((({.(((((((((((((..(((.(((({.......((((..(((((...((((((((,,..,...((({{,..{{{{.{{..{(.(((((((((((((,,...,,{{{....,..,,.((((((((((((,..((((((.{((({((((((((..((((((((((.......(((({,(((.......))))))))))))..)}}.,,))}..)))))))))))}.)))))).......,,|.,,.,{{{....)))},,}}}}.},,,....{(((((((((........(((((({{..{{{(,((...|||,.{,.(((.,.{.....|,.}}).}..}))...,))})))..}}.))))))........)))))))).))..}.)))}})))))}})),),.,...,,,))))))))))))).}}...(((((((......)))))))...(((({...})))).{{,...|||,}}..}},......))}))),}}}}}.....,.}.)))))))).))))).))))....{((((((.,(,..{{{....}}}..,,.,,,..))))))}})))).)))..))))}...}.,))))))(((((.,...,}))}|,....,.))}))))))),))},}}|||......{(((((((((..,,,,,|.})),}})))}}.,,,,,},},.||,,,,.||||||,.,,,..}}.{{{...}}}.||,,||||{.,..})),},.....|({{..,.....)))}}||},.,})),}}||.((((.....))))))).)},))),))).)))))))))).}.))).))))))),,....||||(({,...,})))|((({{....(((((({{{((((((((((,......}||}{{.((((((..((...,,....,.))..)))))))}.||||||||...,.((({((((({(((...(((((.(((((...))))).)).))).,.))))))))))}{{{{|....,}}}))))}((((..((((......))))....))))........)))))))))))))).......)}}))})))))))},.||},,,},,,)).,,|||||}.}}|||}{{{..,,,)))...........))))).)))))))(((((((.....,,....((((.,{{...((({(.{((((.((,.(((.{{(({..|||{,..,{(({.{|...}).)))).(((((....||||||..,,,|}||}|,|}|,}}}}}}}.})),)),,,})}..}}})||||,,.,)))).((((((((((..(((.....((((......))))....)))......))))))))))...)))).))).,
Forensic Context

No forensic context available.