Basic Information

Symbol
hsa_PIP5K1A_0004300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PIP5K1A_0072
Host gene
PIP5K1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:151199796-151211654 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:151227320-151239178 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-311.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -335.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 334.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.....)))((((.((((.(((............((((.....((((((.((((...))))...))))))..............(((((((.(((.(..((((((((((.(((((((....(((((...)))))..)))).((((((((((.(((((((((((((..(((.(((((.......((((..(((((...((((((((.(..(...(((((...((((.((..((.((((((((((((((((....)))......((.(((..(.((((((((.(((((((....(((((.(((..((((..((......))..)))).))))))))....(((((...)))))..(((((((.....(.(((((.(..((((.........))))..)))))).).....)))))))......((((((((((........((((((((..((((.((...(((.....(((............)))....)))....))))))..)).))))))........)))))))).))))).)).)).)))))))).)..)))..))))))))))))))).))...(((((((......)))))))...(((((...))))).......(((.....)))......)))))).)))))....)..).)))))))).))))).))))....(((((((..((..(((....)))..))......)))))))))))).)))..)))))...).)))))))(((((......))))).......))))))))))...(((((((.......((((.(((((.((((((.((((((((.........)))..)).))).))))))..........(((...))).((..(((((....))).))..)).((((........))))))))).))))...((.((((.....)))).)).)))))))))).)))))))))).).))).)))))))......((((((.....))))))......((((((.((((....)))).))))))..))))......(((........))).....(((((.((((((.((......)))))))).))))).)))..)))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({((...,,|||((((,{{{(,(,,...........|||,,,,,,.((((((.((((...})}).,.))))))..............(((((((.(((.{..((((((((((.(((,(((.,,.(((,,..,|||||{{||||(((((({{{{{.(((((((((((((..(((.(((({.......((((..(((((...((((((((,,..,..,((({{,..{{{{.{|,,{(.(((((((((((((,,...,,{{{....,..,,.((((((((((((,..((((((.{((({((((((((..((((((((((.......(((({,(((.......))))))))))))..)}}.,,))}..)))))))))))}.)))))).......,,|.,,.,{{{....)))},,}}}}.,,,,....{(((((((((........(((((({{..{{{(,((...|||,.{,.(((.,.{.....|,.}}).}..}))...,))})))..}}.))))))........)))))))).))..}.)))}})))))}})),),.,...,,,))))))))))))).}}...(((((((......)))))))...(((({...})))).{{,...|||,}}..}},......))}||||||}}}.....,.}.)))))))).))))).))))....{((((((.,(,..{{{....}}}..,,.,,,..))))))}})))).)))..))))}...}.,)))))}(((((.,.,.,}})||,....,.))}))))))),))},}}|||......{(((((((((..,,,,,|.})).})))))}.,,,,,},},.}|,,,,.||||||,.,,...}}.{{{...}}}.||,,||||{.,..}}),},..,,.|({{..,.....)))}}||},.,})),}}||.((((.....))))))).},,))),})).)))))))))).}.))).))))))),,...,((({((.....)})))),.,,,.((((((.((((....)))).)))))),,})))},....|,|,}|||...}}},..{{(((((.{(((({,((......)))))))).))))),))},,}}}).))))
Forensic Context

No forensic context available.