Basic Information

Symbol
hsa_PIP5K1A_0007700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PIP5K1A_0086
Host gene
PIP5K1A
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:151217043-151218106 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:151244567-151245630 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-320.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -337.31 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 207.34
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((....)).)(..((((((.(.((((((((((((((((.((((.(((((((.(((((((((((((((((((((.(((((.(((((((....((((((((((..(((((((((....(((((((.(((((((((((((((((((...........))))))))))..((..(((((.((((((((((((..(((.((((.(((((..((((((.((((.(((.((.....)).)))..))))....((.(((.(((......)))...))).))(((((....((((((.....(((........)))....)))))).)))))..........(((((((((...((((........))))...)))..................(((((((.......(((((....((((...)))).....)))))........)))))))((((((((.(.((((((....((((....))))............(((.....)))((((((((((((...((((....((.(((((...))))).))(((....)))....................))))....)))))))((((......)))).......)))))......)))))).)))))))))....(((((((....)))).)))((((.(((((.........)).)))...))))....................((((..(((....)))..))))..)))))).....((((.......))))....)))))).....................(((......))).))))))))).))).))))).)))))))...))))).))(((......))).)))))....))))))))))).........(((....))))))))))))...))))))))))))))))).))))).))))))))))))))))))))).))))))).))))..((((((((((((.(((..(((.((((((.....))))))......))).))).)))))))).))))..)))))))))))))))).).))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((....)).)(..((((((.(.((((((((((((((((.((((.(((((((.{((((((((((((((((((((.(((((.(((((((.,,,((((((((((..(((((((((,,..(((((((.(((((((({{(((((((((...........)))))))))},(({,,((({,.{{((((({((((,..,,.{(((,((((({{((({{,.((((,(((.{{.....)).)))..)))}....{{.(((.(((......)))...))).}}(((((....{(((((....,((,.....,},,}}....)))))).)))))..........(((((((((...((((........))))...)))..................(((((((.......(((((....((({...}))).....)))))........)))))))((((((((.(.((((((....((((....)))}...........((((.....)))).,.{(({(((({,,((((,,..{{.{({{,...))))).))|{{....)),.....,}.,,,,.},,...,||||,,..,||||},((((......)))),,.....))))),.....)))))).)))))))))....(((((((....)))).))){(((.(((((.......,.)).)))...))))....................((((..(((....)))..))))..))))))...,}||||,,.},,.)))),,}})})))}.....................{{{,.....))}.,,}})}}},.,||,|}}|||,}}}}},...)}}}),},{||,,....}},.,))))....))))))))))).........,,|,,,,)))))))}})))..,)))})))))}))))))).))))).))))))))))))))))))))}.))))))).))))..((((((((((((.(((..(((.{{{(((.....}}}})}....,.))).))).)))))))).))))..)))))))))))))))).).))))))..)
Forensic Context

No forensic context available.