Basic Information

Symbol
hsa_PITX1_0000200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0074027 hsa_circPITX1_001
Host gene
PITX1
Type of circRNA
Intergenic-Exon
Location (GRCh37)
5:134363424-134369964 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
5:135027734-135034274 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1169.88 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1204.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 630.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.((((((((((.((((((((..((...(((.(((((((((((.((.(((.((.(((((.(((((((((.(((....((((((((((.((((........)))).))))).((((((((.((((((((..(((.((.(((((((((((.((((((((((((((((.(((((((..(((.((((((..((.((((...((((...(((((((((.((((((((.((....)).))))))))..)).)))))))...)))).)))).)).))))))))).((((....)))))).)))))..))))))))))))))))......((..(((((((((((((((((((.......)))))(((((((((....(((((((((.(((...(((((.((((....)))).)))))((....))((.((((((((..(((.(((((..((((....))))..))).((((((...))))))...(((........))).(((....))).)).)))..)))))))).))..(((((.(((((...)).)))...)))))((.....))..))).)))))))))....)).))))))).(((((.(((((((((((((.((.(((((((((((((((.............((((((..((((((((.((((((.((((..(((((((((.((((((.(((((..(.(((..(.((((((((((...)))))......(((..(((....))).))).((...((((((..((((((((((((((((.....)).))).)))).))))))).....)))))).))..))))).).))).)..)))......)).))))).).))))...)))))..)))))))))).)))..((((((((((...........((((...(((.(((...))))))))))......))))))))))..(((((..((((....))))))))).........)))))..))))))...(((...)))...)).))))))))))))).))))))).)))))..))).....))))).....((((((......))))))((....))))))).)))))).)))))..)))))))))))..........)).)))..))))))))..))))....))))..(((((.(((((....)))))..))))).(((((...(((......))).....)))))....(((((((((..((..((((((((((((((...((((((((.((....)).))))))..))...)))).))))((((((....)))))).....(((.(.((((......)))).)))).((((((..((....))..))))))((((((.(((((((((.((..(((((((.(..((((.(((.((((((((...((((....))))...)).).)))))..)))..)))).).))))))).)).))))........))))).))))))))))))((((((..(((((((((.(((.......(((.....................................))).......))).).)))))))).)))))).....)).))))))))).)))))))).))))))))).))))).)).))).))....((((((((((((.....))))).).(((((.((.(((((((..(((.(((...((((((((((((((((((((((....))))..((((.((((((((.(.((((.(((((((.(((...((((((((((((((((..((.((((((((((((((......))))).........)))))))))...........))..))))...)))))))))))).((((......)))).)))))))))))))).).)).)))))).)))).((((((.......))))))((((......)))).(((....)))(((....)))))))))).)).))))....)))))))).)))))))))).))..))))).......)))).))))))))))))).)))(((((((((.(((((((((.(((((..((.(.........(((((((((((.((((..(((.(..(((....)))..).)))..))))..))))).)).))))((((.......))))).))..))))).)))).))))).((((.((.........))))))((((((((((((((((((....))))..)))))).))).........)))))..)))))))))))..)))).))))))))))))))....(((((((((.(((........(((......))).........))))))............)))))))).)(((...)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,.((((((((((.((((((((..((...(((.(((((((((({.,(.(((.((.(((((.(((((((((.(((....{({{,(((((.((((........)))).))))).((|((((({((((((({..{({|((.(((((((((((,((((((((((((((((.(((((((..(((.((((((..((.((((...((((..,((((((({(.((((((((.((....)).))))))))..}}.)))))))...)))).)))).)).))))))))).((((....))))))}}))))..)))))))))))))))).|,||.{{..{{,{(((((((((((((((.......)))))(((({((((.,,,(((((((((,(((...{(({{.{({,..,,|||}.})})|{{..,.||{{,({(((((,{{((({(,,,}}}||||.}}}))|||,||}.((((({...}))))).,.{((.......,))}.{|||.{{|}|.,},}})}},))))|||.}}..(((((.(((({...}}.)))...))))),}},}.)})..))}.))))))))),...}}.,})}})),(((((.,({((((({(((((((.(((((((((((((((.(.{,........,{((((,,((((({((.(((((,,((((..(((((((((.((((((.(((({..{.(((..(.((((((((((...)))))..,,.{(((..(((....))).))).||.,.((((((..((((((((((((((((.....)).))).)))).)))))))....,)))))).},..))))).).})).)..)),....,})).))))).).))))...)))))..)))))))))).))}..((((((((((...........((((.{,({{.(((...))))))))))......))))))))))..{((((..((((....))))))))}.........)))))..)))))),..||,...),)..,)),))))))))))))).))))))).)))))..)}),,.,.}}}}}.....{{((((......))))||(({{{{||},,,}})))))}.,))}}..))))))))))}.............}}}..))))))))..)))|..,,||}|,.{{(((,{((((,,..}||||..|||||,(((((...(((......))).....)))))...,|(|{((((({(((,{({,,,,|||{||||}.{({((((((.((....)).)))))),,,}|}||||,|||,{((((((....))))))}....{{{.{.((((......)))).||}},((((((,.{{..,,)),.))))))((((((.(((((((((.((..(((((((.(..((((.(((.((((((((...((((....))))...)),}.)))))..)))..)))).).))))))).)).))))........))))).)))))))}))}|{(((({,.{((((((((,(({.......{{{.....................................))).......))),).))}))))},)))))}....})).}))))))}}.,})))))).))))))))).))))).)).))).)}....||(((({(((((.....))))).)}(((((.((.(((((((..(((.(({,..{(((((((((((((((((((((....))))...,((|((({{({(,(|{(((,(((((({{(((...{((((((((((((((({{((.(((((((((,(,(({..,..,,})},..}}}.,.)))))))))..)},.)},..}|..}}}}.,,,))))))))))}.((((......)))).)))))))))))})},),)).)))))},))),.((((((.......))))))((((......)))).{{{.,,.))){{{....)))))))))).))}})))....)))))))).)))))))))).))..))))).......)))).))))))))))))).)))(((((((((,((((((,(({((((({{(,,,,,,.,.,..(((((((((((.((((..(((.{..(((....)))..}.)))..))))..))))).)).))))|,||,}.....||||.....}))))),))))})),))})))|.,,.......({(||((..{.(((((((((((((((....))))..)))))).)))})).,..),))))...)))))))))}),.)))).))))))))))))))..,{(((((((((.(((.....,..(((......)))..},.....))))))............)))))})},)(((...)))
Forensic Context

No forensic context available.