Basic Information
Symbol
hsa_PLXND1_0001300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0067300
hsa_circPLXND1_020
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:129279173-129284860
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129560330-129566017
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-344.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-361.87 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
290.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((.(.(((((((((((..((((((.((((((....(((((((................)))))))..)))))).))......((((....((((...))))....)))).((((.(((((((...((((((((........)))))..)))....))).)))).))))(((((.((...)).)))))..))))..)).)))).((((((.((.............)))))))).........(((....)))))))).).))))))((.((((((((((((((..((((....)).))..)))))...(((.((((((((...((((((..((((.....))))))))))(((((((.((......))))))))).........((..(((((....(((......)))..(((((((...((.(((((((((..((..((.(....).)).)).((.(.(((((((((.((((...((.....)).)))).))))).)))).).))))))))))).))))))))))))))..)))))).)))))))..(((((.(((((...(((.(((((((((((((.....(.((((.....(((((((((((.((((.((((.((..((((......))))))))))..)))).).).))....((((((.((.((.(((.(.((((((((.((((..(...((((((..............)).))))..)..))....))))).)))))).)))..))))....((((...))))..)))))).....)))))))((((((.....)))))).....((((....((((...((((.(((.((..(((.....)))..)))))))))))))))))...)))).)......)).))))))).)))).)))..))).))))))).......)))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{,,{(,({(({((((((((..,,{(((,((((({....(((((((................))))))).,||||||,||{{{,,{(({{,,{,((((..{||||,{{.||||.,{{({(((((((,..((({((((..|,,...))))),,})).,}}))},}|}},))}}(((((.({...,|,|||||,.|,},..}}.},))}|||||{.,{,,..,{.,{{...|)|}}}}}.,.......{||....))))))))}).}})}))({.((((((((,,{{{{,,||||....)},})}}),)))||.|||.||||{||{.||{|||||}|||||}||||)),}}}})))(((((((,{{......)}))))))).........{|}}|(({{....(((......)))..(((((((..,((.(((((((((..{{,.((.(....).}}.,},|(.,.(((((((((.((((...,,.....},.)))).))))).)))).}.},))))))))).))))))))),}}}}..))},},.)}})}},..((((,{(((({...(((.(((((((((((((..{..({{((,,,...{(((((((({{.((((.((((.((..((((......))))))))))..)))).).}.))....((((((.((.((.(((.(.((((((((.((({..,...((((((..............)).))))..,..},....)))))}}))))}.)))..))))....((((...))))..)))))).....))))))|((({((,...,|||}}}...,.{,{,.,,.,|||,..{{(({{(({((..{{{....,,,)|}}},)))})}}}}))))),,,))))},}}),},)),,)))))).)))).)))..))).))))))).),..))))))}}}},})
Forensic Context
No forensic context available.