Basic Information

Symbol
hsa_PLXND1_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0067305 hsa_circPLXND1_016
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:129285370-129303076 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129566527-129584233 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-896.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -930.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 610.93
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((......((((((..(((((.((((((....(((.(((((((......(((((.............((((.(((((.(...((((...((((......))))....)))).).)))))..))))......)))))(((((((((.((((((((((.(((((.(((.(((...))))))....)))))(((((((..........((((((((.((..(.(((((((((((......))).......(.(((((((....))))))).)..((((......))))..(((((((((...(((((....(((((((((...))))))))).)))))....)))))))))..........((((((((((((((.((.((((((((...(((((..((((((((.((((....((.(((((..((((..((....)).))))..))...........)))))..)))))))...)))))))))).....((((((((((((.(((...))).)))))..)))))))..........((((((..(((((((((((((....((((((.((((.(.(((.(((((.((((((((.(((....))).))))((((.(((((..(((((...((((((((((((..((((((((((((.((((((..((.((.(((((...((((((((((..(((((((.((((((......))...(((((((...)))))))(((((.(((...(((((.(.((((((((((.((((((((((.(((.(((..(((((..((((((((.((....)).)))))))))))))))))))))....)))).))))....(((((.(((..(((((.((.((((....))))(((.(((((((...(((((...(((((((.(((((((((((.......(((.(((((...))))).))).)))))))))))(((((((....)))).)))..........)))))))((((((.((....((((.((((.....)).))))))...)).)))))).((.(((((((.((((..((((((((.(((....((((....))))..))).)))...)))))..)))).))))))).))))))))))))))))))).)))))..))).)))))((((.......))))..(((.......)))))))))))))))))))..))).)))))))))))))))).((((....)))).(((((((.((..((....))((((((.(((((((.((((((..........)))))))))...)))).)))))).((.........)))).))))))))))).))))))....))))))).))....)).)))))))..)))))..)))).......)))))))(((.((....)))))(((((((((....((((((..(((.....((((.((..(((((((((.....)))))).)))..)).))))......))).)))))))))))))))...(((....((((........)))))))((((((...))).)))......(((....)))))))).)))))..))))).))))(((.((..(((..((((......))))..)))..).).)))...((((.....)))).....)))))))))))).))))......).))).))))))))))(((((((....))))..)))....))))))))))))..))).)))))))))))).))).)))))).)))))))))..)).))).....)))))((((((..(((((((((((....((((((((.....))))))))......((((((((((.......((((......)).)).......)))))))))).))))))))))).....)))))).((((......))))((....))....))))))))))).))))))..))))...)))))...((((.(((..(((..((..(((..((((....))))..)))..))...))).))).))))...................))))))).))).........((((.....)))))))))).))))).))))))...........(((((((.((..((........))..))))))))).))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((,{{,,,(((({{,,(((((,(((((({...{(({((,,,,{,}},..||||,.............{{{({(((((.{{{{({{,..,||||.,,,,,}}}|,{,,||||.,.|||||,,||,|{{,{{{||||}((((({(((,(({{((({(({((,({.{((|(({,,,,,||}|,,,,||}}|{{|||,,|,........{{{|{||||((,,(.((((((({{(,....{,,.,{,({{,,({(({{{{|,,,.}}))))),}..((((......))))..(((((((((((.(((((....,((((((((...))))))))).))))).)),)))))))))........,||(((({((((({{,,({.{(((({{{...(((|(..((,(((,({(,,,..}}},}||,||.,{||||,||,,|||||||||||||||........}||||}|..}))}}}...}}})),}})},,,,}|{((((((,,,|}|||}..,,,.))))),,))))))),}},...,..((((((.,{((((((((((((...,(({(((,{,((,{.(((.(((((,((((((((.(((....))).))))((((.(((((..(((((...((((((((((((..((({((((((((.((((((..((.((.(((((...((((((((((..(((((((.((((((......)),..(((((((...)))))))(((((.(((...(((((.(.((((((((((.((((((((((.(((.(((..(((({.,((((((((.((....)).)))))))))))))))))))}}....)))).))))....(((((.(((..(((((.((,((((....)))){{.{(((((((...(((((...(((((((.((((((((({{.....,.(((.(((({...})))).))).)))))))))))(((((((....}))).))),.......,.)))))))((((((.((....((({,({((.....}).))))))...)).)))))).((.(((((((.((((..((((((((.(((....((((....))))..))).)))...)))))..)))).))))))).))))))))))))))))))).)))))..))).)))))((((.......))))..(((.......)))))))))))))))))))..))).)))))})))))))))).((((....)))).(((((((.({..{{....}}((((((.(((((((.((((((..........)))))))))...)))).)))))).({,......,.,,}).)))))))))))}}}))))....))))))).))....)).)))))))..)))))..)},}.......))))))){{{.,{..,,|||||(((((((((....((((((..{((.....((((,((..(((((((((.....))))))},))..)).))))......)}}.))))))))))))))).,.(((.,..((((........)))))))((({{{,,.))).}))}}}},.(((....)))))))).)))))..))))).))))(((.({.,(((..((((......))))..))}.,)}).)))...{{{{.,,,,}}}),,,..)))))))))))},||},...,)}).}))}))}))))))}{{{((((....))))..)))....)))))})))))).,),,,,}})}}}}}}}}.}}}.))))))})))))||||{{}}.|||,..,.||}|,((((((.,(({{{((((((,,,,((((((((.,...}||}}|||.,....{((((((({..,,.,|.|||{,|||,..}.)))}}..,)))))}))))),)))))}}))))},.}.))))),.{(((......))))||,,..}),,..,))))}})))).)))))),.)))),,,)))))...||||.{((..(((..{{..(((..((((....))))..))),.)}...})).))),||||...{{....{{{{{...,{|,|,,,,.}})}}...)}}}||||,,,,,,||||||||}.}||}}.}}}}}),...}}}}},,(((((({{((..((........))..))))))))).))))...
Forensic Context

No forensic context available.