Basic Information

Symbol
hsa_PLXND1_0003600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0067314 hsa_circPLXND1_007 hsa-PLXND1_0007
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:129297172-129305115 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129578329-129586272 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-278.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -290.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 141.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((...(((.(((((((.(((.((((((.(((.((...))))).))))))..)))))))).)))))...((((((((.(.(((((.(...((((((.((...(((.((.((.(((.........))))).)).)))....)).))).)))....).)))))))))))))).(((.......)))((..((........))..))....(((((((((((..(((((..(((....((((.(((.((((((((((....((.((.((((.((((.((((((((.((((.((((((......))).......(((..(((((...))))).))).((((((......((((.....))))((((.....)))))))))).((((((((....(((((.....))..((((.(((.........))))))).))).....))))))))))).))))))))))...)).)))).......(((((.....)))))...((((......)))).((((((((((((((..((..(((((((.((...((((.(((((...))))).)))).)))))))))..))..))).)).))))).))))...........))))))))...)))).))))))..)))..))))..)))..)))))(((((((....))))))).........)).))))))))))))))))))...(((........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((((((...(((,{((((((.(((.((((((.(((.({...))))).))))))..)))))))).})))).|.((((((((.(.(((((.(.,.((((((.((...(((.((.((.(((.........))))).)).)))....)).))).)))....).)))))))))))))).|{({{{{{{{|,.((,,((........})..)).,},|,|{|||||,,..(((((..(((....((((.(((.((((((((((....(,(((.((((.,(((,({((((((.((((.((((((......))){{...,.(((..(((((...}))}}.)))|(((({{,..{{.{(((.....)))},||{.,,,,)))))}})}}.((((((((....{((({.....||..{(((.{{(.........))))))).))).....))))))))))).)))))))))).,,)}.}},,.......(((((.....)))))...((((......)))).((((((((((((((..((..(((((((.((...((({.(((((...))))).))))}),)))))))..))..))).)).))))).})))...........}}}})))}...)))).))))))..)))..))))..)))..)))))(((((((....))))))),,..{{{{.,,.,,))))})))))))))))...(((........)))
Forensic Context

No forensic context available.