Basic Information

Symbol
hsa_PLXND1_0003800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0007597 hsa_circPLXND1_003 hsa-PLXND1_0002
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:129302410-129308370 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129583567-129589527 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-379.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -394.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 193.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.......)))))).(((((.(((((......)))))....(((((.......)))))...(((.((((.((..((((...))))...)))))))))((((((((((((((.((((.(...((..((....))..))...))))).))))))).)).))))).(((((....(((...)))..)))))..((((((((((..((((..(((((((((...((((((.(((.((((((((((((...((((.......))))...((((....((((.((((((((((.....((((......))))....)))))))))).)))).))))...)))))).....((((((((.((((.(((((((((((((((......((((((((.(.(((((.(...((((((.((...(((.((.((.(((.........))))).)).)))....)).))).)))....).))))))))))))))))))).))).......(((((((...((....))....).).)))))))))))).))).).)))))))).....)))).((((((((((((.(((((...(((((.((.(((((....)))))..)).).))))))))).)))).)))...))))).((((((((((.((..((.((((.....)))).))..)))))))))..))).((((((((....(((((.....))..((((.(((.........))))))).))).....))))))))..)).)))))))))...)))))))))....)))).))))).)))))...((((......)))).((((((((((((((..((..(((((((.((...((((.(((((...))))).)))).)))))))))..))..))).)).))))).))))...........)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.......)))))).(((((.(((((......)))))....(((({.......)))))...{(,{((((.((..((((...})))...))))))))}((((((((((((((.((((.(...((..((....))..))...))))).)))))))},)}))))},,((((..,.((,...})).,))))),.{(((((((((..((((.,(((((((((...((((((,((({,.,|||||(((({....(({((((((,,.({{,{(((....((((.((((((((((.....((((......))))....)))))))))).))))..|||{..,}))),.....|||||||}}}|||}|||||||((((((((......((((((((.(.(((((.(.,.((((((.((...(((.((.((.(((.........))))).)).)))....)).))).)))....).)))))))))))))),)}|}.}}}..,,,,||||{|||..,{({{{{||,,,,|.|{|,||,,,,,)),}))}.,,}),}},,)}}}}}))||{((((((((((((.(((((...{(((,.((.(((((....)))))..)).,.))))))))).)))).)))...))))).,|||{(((((,|{..{{.((((.....)))).}|,.}}}}))))|,,,}}.((((((((....{((({.....||..{(({.{{{.........))))))).))).....))))))))..},})),))))))...))))))))}.,,.)))).))))).)))))...((((......)))).((((((((({((((..((..(((((((.((...((({.(((((...))))).)))}}),)))))))..))..))).}}.))))).))))...........)))))
Forensic Context

No forensic context available.