Basic Information

Symbol
hsa_PLXND1_0004100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0067316 hsa_circPLXND1_002
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:129302968-129308370 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129584125-129589527 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-340.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -354.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 169.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.....((((.(((((.((((.(((((......)))))..)))).)))))..)))).....))).(((((.((..((((...))))...))))))).....(((((((((((.((((.(...((..((....))..))...))))).))))))).)))))))(((.(((..(.(((...))).)..)))..((((((((((..((((..(((((((((...((((((.(((.((((((((((((...((((.......))))...((((....((((.((((((((((.....((((......))))....)))))))))).)))).))))...)))))).....((((((((.((((.(((((((((((((((......((((((((.(.(((((.(...((((((.((...(((.((.((.(((.........))))).)).)))....)).))).)))....).))))))))))))))))))).))).......(((((((...((....))....).).)))))))))))).))).).)))))))).....)))).((((((((((((.(((((...(((((.((.(((((....)))))..)).).))))))))).)))).)))...))))).((((((((((.((..((.((((.....)))).))..)))))))))..))).((((((((....(((((.....))..((((.(((.........))))))).))).....))))))))..)).)))))))))...)))))))))....)))).))))).)))))...((((......)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((.....((((.(((((.((((.(((((......)))))..)))).)))))..)))).....))).))((...((((({(,...}}},..)))))....,{{(((((((((((.((((.(...((..((....))..))...))))).)))))))},))))))|{{{(((..,.((,...})).,)))))..((((((((((..((((.,(((((((((...((((((,((({,.,|||||(((({....(({((((((,,.({{,{(((....((((.((((((((((.....((((......))))....)))))))))).))))..|||{..,}))),.....|||||||}}}|||}|||||||((((((((......((((((((.(.(((((.(.,.((((((.((...(((.((.((.(((.........))))).)).)))....)).))).)))....).)))))))))))))),)}|}.}}}..,,,,||||{|||..,{({{{{||,,,,|.|{|,||,,,,,)),}))}.,,}),}},,)}}}}}))||{((((((((((((.(((((...{(((,.((.(((((....)))))..)).,.))))))))).)))).)))...))))).,|||{(((((,|{..{{.((((.....)))).}|,.}}}}))))|,,,}}.((((((((....{((({.....||..{(({.{{{.........))))))).))).....))))))))..},})),))))))...))))))))}.,,.)))).))))).)))))...((((......)))).))
Forensic Context

No forensic context available.