ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_chr3_0161100
Basic Information
Symbol
hsa_chr3_0161100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PLXND1_0020
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:129280193-129280694
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129561350-129561851
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-193.00
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-197.74
kcal/mol
Frequency:
0.0005
Diversity:
30.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((((((((((((((.....(((((((((..((((...((.(((((((((......))).((((.(.(.(((((((.(((.(((((((...))....))))).)))))))))).).).)))).(((.(((((.....))))).))).((.((((((......)))))).))....)))))).)))))))))))))))(((((......(((((....)))))..(((((((.(.(((((.((.(((((((((......))))...))))).)).))))).((((....))))......).)))))))...((.((((((((.((((((...)))))).))))))))))....)))))..........))))))))))))...((.....))..))))(((........)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((((((((((((((.....(((((((((..((((...((.((((((((,......,,,.((((.({(,(((((((.(((.((((({{...})....))))).))))))))))}).).)))).(((.(((((.....))))).))).((.((((((,...,.)))))).)).}}.)))))).)))))))))))))))(((((......(((((....))))),.(((((((.(.(((((.((.(((((((((......))))...))))).)).))))).((((....))))......).))))))).|.{(.((((((((.((((((...)))))).))))))))))....)))))..........))))))))))))...((.....))..))))(((........)))
Forensic Context
No forensic context available.