Basic Information

Symbol
hsa_PLXND1_0002600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PLXND1_0025
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:129286541-129291784 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129567698-129572941 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-456.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -475.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 345.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((.(((...(((....)))...)))))).)..(((((.(((..(((((.((.((((....))))(((.(((((((...(((((...(((((((.(((((((((((.......(((.(((((...))))).))).)))))))))))(((((((....)))).)))..........)))))))((((((.((....((((.((((.....)).))))))...)).)))))).((.(((((((.((((..((((((((.(((....((((....))))..))).)))...)))))..)))).))))))).))))))))))))))))))).)))))..))).)))))((((.......))))..(((.......)))(((((..(((((((.(((((.(((((((((((((((((.(((((((.((((((((((((.((((((((.(((((((((.(((((((.((((((..........)))))))))...)))).)))))).(((.(((.((((..(((((....(((((((((((.....(((.((((........)))).)))...))))............)))))))(((.((....)))))(((((((((....((((((..(((.....((((.((..(((((((((.....)))))).)))..)).))))......))).))))))))))))))).)))))....((((........)))).....((((((((......((.(..(((....)))..).))......)))))))).))))...))).))).((((......))))......((((((...(((((..((((...))))............(((((.....)))))..))))))))))).(((((((....))))..)))...))).)).))))))))).))))).)))).((......))....((((((((((((.((((......)))).))...........((((....)))).))))))))))))))))).))))).((((((((......))))..)))).......)))))))))))).....))))).))....)).)))))))).......))))(....((....)).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..,,,{(((.({.((((.(((((((({{{{,....(((((.(((..(((((.{(,((((....)))){{.{(((((((...(((({..,(((((((.((((((((({{.....,.(((.(((({...})))).))).)))))))))))(((((((....)))).))),.......,,)))))))((((((.((....((({,({((.....}).))))))...)).)))))).((.(((((((.((((..((((((((.(((....((((....))))..))).)))...)))))..)))).))))))).))))))))))))))))))).)))))..))).))))).,|||}.,,((.|(((,{((.(((((.{((((((..(((((((((((.,,.......)))))))..)))).......))))))))))).)).,||{.|,|)|((((((.(((((((.((((((..........)))))))))...)))).)))))}.|||||}},.,,,,.(((((....(((((((((({.,.,,(((.((((,....,,.)))).))).|,))},....,,,.....))))))){{{.{{....)))))|||{{{(((.,,.((((((..{((.....({((,((..(((((((((.....)))))),,))..)).)))),.....)}}.))))))))})))))}.))))).,.(((((({......{{.,,,,||({{(((((....,{(,,{..{{{....)))}.)}),...,,,))))))}}.{{(((.({.,(((..((((......))))..))}..)}).))).}},,({,{{{{,,,)}}},..,,}))))))(((((.....))))).)))))).)))))).)).}))}(((((((.,{,.....{{(((.{{{|...{{..,,.}),,.}}.||}}.}}),,,.}}|,)))))))(({({{,,{,,,.||,}.||{,{{.|{{,{,((((({,,||{(({|{((||..||||}}|||.,,...{((({((({..,,.,|.||||,|||,..}.)))}}.,,)))))}})))),})))))}))))),})|)))))..}))).))))(..,.((....)).....)
Forensic Context

No forensic context available.