Basic Information

Symbol
hsa_chr3_0161300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PLXND1_0013
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:129289662-129293271 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129570819-129574428 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-197.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -205.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((.(((..((((((((((((....(((((.....)))))..(((((((..((((.((.(......).)).)))))).)))))((((.(((((..(((((.((((((((((((((.....((((((....((..((((((((.(((((..((((((((((((((....)).....)))))..)))))))((((.((((((((....)))..))))).))))...))))).)))))))).))....)).))))..))))))((((((((((.((....((((((((...(((......)))....(((.((((.((...)))))).)))....))).)))))..))))))).)))))..((((((.((.(((.....))).)).))))))....))))))))...)))))..))))).))))(((..(((....)))..))))))).))))).)))...))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
....,.{{(.(((..((((((((((((.,{{(({{,,,,..||||{{.(((((,(..((((.((.(......).)).)))),}.)))))||||}|((((,.(({{({((({{(((((((,,...}}|||||{.|,.||}.{||{||||,(({{{..{{{({(({{(((((....}}.....)))},..))))))}|||{.|((((((({{{,||,,{|}}}},||||{{.}}}}}.||||||||{||{...||{||||{{|,,|}.((((((((((.((....((((((((...{,{......}}|,...(((.((((.((...)))))).)))..}}))).)))))..))))))))))))).}}||||,.,,.,,,.}}}}}},}))}))))))}}}})))))))),.})}))).,)))))})}},{((,,|{{..}}))),,))))))).))))).)))...))),),..,,
Forensic Context

No forensic context available.