Basic Information

Symbol
hsa_chr3_0161500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PLXND1_0017
Host gene
PLXND1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:129290580-129293262 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:129571737-129574419 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-202.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -208.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 126.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((((.....((((((((..(((.((.(((((((.((.(((((((((..(((.(.(((....)))).))).))))))........)))))...))))))).)))))((((.((..(((((((((.....)))..))))))...)).))))((((....(((((.((.((((..((((.((..(((((((((((((((((((((((((.......))))))))))......)).))))..)))).)))))...)).)))).))))..)).)))))....))))......((..(((((........))))))))))))))).(((((.((..(((.((...)).)))..)).)))))(((((((...(((.((((...)))))))...).))))))..))))))))).))))(...........)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((((((,,..,{,{((((({((((.,,,|||{,,,..{{(((({,((,..(((.,{((((((,|{{{{||}.||||||.,||,,|||}|||..,|}|||||.}}.||((((.((..(((((((((.....)))..))))))...)).)))}||((....(((((.((.((((..((((.((..((((({(((((({((((((((((((.......))))))))))......)).)))),,}))}.}))))...)).)))).))))..)).)))))....))))},,},,|},,}}}|,.)}}}}}.),)))))))})))))}{||||}|,..,,,.,({{{{,.,,)}})),)))))||(((((...(({{((((...)))))))...)))))}))..))))))))).))))(...........)
Forensic Context

No forensic context available.