Basic Information

Symbol
hsa_POLR2A_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0041884 hsa_circPOLR2A_033
Host gene
POLR2A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
17:7404608-7415333 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:7501289-7512014 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-793.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -837.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 747.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((.(((((((...((((((((((((((.(((.........(((((..((((.(..(((.((((((.((((....(((((((((...(((((((((..(..((((........(((((.((((((.....(((((....))))).((((..((((.((((((..((....))..)))))))))).))))............))))))...)))))............((.((.((((..((((((((...(((((((((..(((((((((((.(((.((((....))))(((..(.(.((((((((....))))))))...).)..))).....)))..)).)))))))))..))))(((.((((((((....(((((...)))))....))))...))))))).((((..(((((....))).))..))))((((((...(((((((((((....((((.(((((((.((.((((((...(.(((((((((.(((((((((.(.((((((...(((((....))))))))))))))))..))))...)..)))))))).).)....)))))).)...((((((..(((((.(((.(((((((((((....)))))..(((.......)))(((.((((..((((((..((..((((...))))))))))))..)))).)))....(((((((....)))))))((.((((.(((.....))).)))))).(((((((......)))))))...))))))))).))).)).........))))))..(((((......)))))((((((((....(.(((((((((.((((...((((.((...(((.(((.((((...(((..(((.....((((((((((.((....(((.((((.((.((((.(((((.............))))).)))).)))).)).((((((((.(((................))))))))))).(((....)))(((.....))))))....).)...))))))))))......)))..))).....)))).))))).)...)).))))...)))).))))).)))).).....))))))))).)))))).).))))....)))))))))))))))))...)))))...))))))))..)))).)).)).((((..(((((..((((((((..((((((............)))))).))))))))..))))).)))).))))..)..)))))))))...))).(((..((((.(((((.(.(((((((....((((.(.(((((.((((.((.......)).))((.((((((((((((.((.(.((.(((.(((((.(((..((.((..(.(.((((((......)))))).).)..)).))))).)))))...))).)).).))))))).)).....))))).))(((((.(((......))).)))))............)).))))).)))))....))))))).))))))..))))..))).))))....))....))))...)))))))))..).)))).....)))))(((((.((((((.((((...((((.(((....).))..)))).)))))))).)).)))))........(((((....(((.(((((.(((....))).))))))))))))).((((((..(((((.(((.........))).)))))..))))))))))))))))).......((((((.(.(.(((((((.((.((.(.((...))..).)).)).))))))).).)))))))))))))...))))))).)).))))))(((((((((((((.....)))..(((((.(((....))))))))...................(((..((.(((((......))))).)).)))...)))))))))((((((.(((((....(((.(((..(((.(((..(((((((((.(((.((((..(((((((((.((((((((..((.(((((..(.(((((((((....)))))))))))))))..))..).)))))))..(((((((...)))).))))).))))))).))))))).).((((......))))............(((((.((..(((.(...((((((....))))))))))..)).))))).)))))).))..)))))).))))).)....))))))))))).....((.(((((...))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(({{,((((((,{{,({{{{|||{|||||,|{{,,.,,,,..{((((.,(({{.{..(((.,,{(((,{((({{,{,,(({{({,,,,({(((((((,.{,{(({,........((({{((((((((..,{{{({|....{(({{,((({..{(,((((((((..((....))..)))))))))|,||||{,}}.....{{{{(((,(((((((((((........))))}..........{{{{{{{{..,((((({(({.((((((...)))))).{(({....}))}{{(,{(,{.((((((((....)))))))}...|{|{{|||{,,({{((.,||.,}},|||},.,}}.,{||,{|||||{{..,.(((((...}}}}}....|||}.,,||}|||}.((((..((((,....,)),))..))))||{({{,..(((((((((((....{{((.{((({((.({.(({{{{.,,||{((((((((.{(((({{{|{(.((((((...(((((....)))))))))))))}}},.}))),..}..))))})}},)}),.,,)}})))|||,,|(({((,.{{(((.(({{(((((((((((....))))),,(((.......)))(((.((((..((((((..,{..((((...))))),))))))..)))).)))....{((((((....))))))}{(.((((.(((.....))).))))}),(((((((......)))))))...}}))))))).))).||{|,..,},.}))})...(((((......}))))((((((((.,,,(.(((((((((.((((.,,((((,((...,{{.||{,|{||...{((,,((({{,..((((((((((.{(,({.{{{.((({,((.((((,((({,....,,,,...,,})))}.}}}}.}}}..||.{(((((((,{((.,,...........},))))))))))}{(({....}))|||....,)),))),||,}.}...|}}}}}}})),.,...)))..))),....)))}.})))).,,,,)},))))...)))).)))))},))).).},,.))))))))).)))))).),))))...,))))))}))}})}))))}}}}}}||{{|||||||||{,,|{{|||||,,{{{{..(((((..((((((((..((((((...{....|...)))))).))))))))..))))).)}}).}}||||||,|}}}}}}}},.,}||.,,|{{{{,,.{{||{.|.{{{{{||....{||{.{.|||||||,||.{{.......)).})}},||,.,.||||||||{,||||.(((.{{{((.(((,.((,((,,{.{,((((({..,,..||||}|,|,|,.}|,|}}}}.}}})}...))).,)},,)))})))}.......||||.{{.(((((.(((......))).))))).}}.,|,},.,.,}.}}}}).)))}),,,,))))}))}})})))...}})}}),,.})))....}}....)))),.}}}}}}|}}}..|,||}},|{{.||}}|({{{{,||||{||||{{,,.||||.,,|,,.,},))}}))),.,}}|||||,,|,|}|||,{{,.{....||,.}}||{|,|{|||,|||,,.,))),)))}||||||....,{||||.,|{{||,|}|.|||,,,}||||.|||||,{|||||}}}}||||}}||.,.....((((({,(.(.(((((((.((.((.{.(,...,}..}.)).)).))))))).).)))))))}}))))..,))))))}.}|.|}}}||(((((((((({((.....}})..(((((((((....))))))))...................(((..((.(((((......))))).)}.)))...)))))))))|{||{{.||(((....|||.{(({.{,,||||,,|||||||||.|||,{{{{.,(((((((,,.{{{{{{{{.,||,||||,..{.(((((((((....))))))))))))))),,))..)))))))))..{{|||||,.,}})).))),,.)))}})),))))))),}}||||,.,,,}}}}......,,,,,},|||||.||,,|||}|...|||||,,,}}}}||||{||,..,,}))))),}}}|}}.}},,)}))},.}))}}.),.|.}||||}||||}....,||},||||.,.,))},,})
Forensic Context

No forensic context available.