Basic Information

Symbol
hsa_POLR2A_0007600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0041891 hsa_circPOLR2A_040
Host gene
POLR2A
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
17:7416340-7417935 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:7513021-7514618 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-266.12 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -297.72 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 351.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((..........(((.....((....))....))).....((((...))))..((((((........))))))................................................................(((.......((((.............((.....))............))))......))).......((((.................))))..................((.....))...........(((((...............)))))...)))))((((....(((((...((....))......)))))...((.((((.....(((((....((...((((.(((((((.................((((.................)))).................((((((((((..(((.((((((((((...((((....(((((............................((((..(((((...((((((((...((((.......(((..........((((....))))..........)))........................((((.................)))).......(((........))).......................(((((((....................((((.....))))...((...((((.....))))...)).........................(((((..((((.(((((....((((....))))..................((((((....................................)))))).........................................................................(((((....((((.....((((....((((((....................................))))))(((......(((((((......((((...........(((.....))).......((.(((.(((.((((((.((......))..........(((.......((.((((...)))).))..))))))))).))).))).)).))))..))))))))))((((((((((.((((...(((((...)))))(.(((((...))))).)..(((((......)))))..........))))))).)))))))........(((....))))))).....)))).....)))))..........((.((((((....))).))))).........))))).))))...)))))....))))))).............................))))........((((...)))).....))))))))))))).)))))))))...))))....)))))).)))).))).......))))))))))..)))))......))))))......))...))))).....)))).)).((((((......)))))).....(((((((....))))))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({((((,...{,.....,({....,|}...,|......}.....((((...))))..((((((........)))))),{.............................................................,{,....,,,,,,|,............,(({....{,....|,.....||}|.......|,,.......{{{{.................||||....,,...........,{{,....},...........{{{{,...............}}|||....,....,......{((({,...{.....},.....))))}....,.(({{.....(((((....,............((((.{{{{,{{........,((((.................||||.................||||{{{{{{..(((.((((((((((...((((....(((((..,............,},..........((((..(((((...((((((((,..{{,,.......(((..........((((....))))..........})}.........,{.............((((.................)))).......{,.........|,,..................{{...{{{{{{{.|,.................((((.....||||...{{...||||.,...})))...|}...},.........|..,.......(((((..((((.(((((...,(,,.....((({{{................,|||||}........,..,......,,,,,,...,,,,,.,,||||||.,......,|,..............................................................,,,,{....,,,,.....,,,.....((((,.....,,,,.{,..,........|,..,{,,.....,))),,,.{{......||,,.........({{............,}}}..............,,.{{{.{((,(({{{,.{{...,,,)}..........{{{.......{(,((((...)))).))..},,}))))).))),))}.)).))))..)))))))|{|({((((((((.((({...(((({...}}}}}{.({{({...)}}}}.,.|({{{{......)))))}....,}}.,))))})),))))))}.......,|{|}}}.)),)))).....))))}}...})))}....,,....||.((((((....)))},)),,....,,,).))))).))))...)))))....)}))))).,,.......................,..})},........((((...))))..,).))))))))))))).)))))))))...))))....)))))).)))).)))....}..)))))))))}..)))))......)))}})}}...}))}..))))).....}))).||.{{({{(,,,...|}}},,..,}}||||||,....}}},,}},...,}))}
Forensic Context

No forensic context available.