Basic Information

Symbol
hsa_POLR2A_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-POLR2A_0065
Host gene
POLR2A
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
17:7402255-7407534 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:7498936-7504215 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-828.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -873.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 512.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((..((....(((.(((..(((((((((((((((.((......((((....)))).......)).)).)))))..........((((((....))))))...(((...(((..(.((((((........)))))).)..)))))).....((((((..((((((((((.......((((.(((.((((((((.((.(.((((((..((((........))))........((((.(((........)))))))(((.((((((..((((.....(((((.(((((((..........)))))))..((((((((....)))))))).((.((((((((........)).))))))))((.((.(((...(((((((.................))))))).....))).)).))..((((((......(((((((..(((((((.......((((((((((((.(((((((((......))))))).(((((.............)))))....)).))))))..))))..)).......)))))))....((..(((.....)))..))((((.....)))).))))))).....)))))).))))).....))))..)))))))))(((.....)))))))))).)))))))))).))).))))))))))))))..)))))).)))))).))..))).))).)))))))))(((((((.(((((((((((((....))))......((((((.((((((((((.((((((..(((((..((((........((((..((((...))))(((.((..(((((((.(((.....))).)))))))..)).)))...)))).......................(((((((((((((......(((((......((((((.(.(..((.(((((((((.(((......))).....(((..((((..((((.((((((..((....))..)))))))))).))))..)))........(((((((((((((((........))))).....................(((((((((.((((((...)))))).((((....))))(((..(.(.((((((((....))))))))...).)..)))...(((((.(((.....(((...)))...))).)))))...(((((((((....(((((..((((.(((.((((((((((..(((((....))).))..))))).((((((((((.((.(.................).)))))).))))))...((.((((((....))))))))((((((.((.((....)))))))))))))))..))).))))....)))))....)))))))))..)))))))))(((((....(((.(((.(((((((((((....)))))..(((.......)))(((.((((..((((((..((..((((...))))))))))))..)))).)))....(((((((....)))))))((.((((.(((.....))).)))))).(((((((......)))))))...))))))))).))).((((........))))...(((((......)))))((((((((....(.(((((((((.((((...((((.((...(((.(((.((((...(((..(((.....((((((((((.((....(((.((((.((.((((.(((((.............))))).)))).)))).)).((((((((.(((................))))))))))).(((....)))(((.....))))))....).)...))))))))))......)))..))).....)))).))))).)...)).))))...)))).))))).)))).).....))))))))))))).))))))))))))))))))).))..).)))))))....((((((((..((((((.((((.(((.((((..(((....)))))))..))).))))..(((((.((((..(.................)..)))).)))))))))))..))))))))..........((.(((((((((((....))))))))))).)).........((((((((((((.......))))).))).))))))))).....)))))))..))))))................((.(((((..((((((..(((((.....)))))....))))))..))))).))....))))....)))))..)))))))))).))..))..)).))))))(((((((....(((..........)))...))))))).)))))))...(((((((.(((((.(((.......((((((.....))))))........))).))))).))))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...(((((({{(,,{,{(((,(({,,,(((({.,,||}|},.|||||......{{,{{{,.........,,}))})},,...,,,....,{(((((....))))))...{{(...{{{|,|.{(((((........)))))).|,,|}||}}..,{{((((((..((((((((((.......((((.(((.(((((((({((.(.(((((({{((({,,......}},)}}}...,,((((.(((........)))))))(((.((((((..((((.....(((((.(((((((..........)))))))..((((((({....}))))))).((.((((((((........),,)))))}))((.((.((({.,(((((((.............,...))))))}...,.))).)).))..((((((.,....(((((((..(((((((.......((((({((((((.(((,(((,({{{,..,))))),.(((((.,........,..)))))}}}})).))))))..}))}..)).......)))))))....((..(((.....)))..))((((.....)))).)))))))...,.)))))).))))).....))))..))))))))},{(,....)))))))))).)))))))))).))).))))))))))))))..)))))),))})))}))}}))}.))))).)))))))(((((((.({((((((({{{{....|}||{{{{,.{{((((,{{({{(((((.((((({..(((((..((((.{,..{{{((((,.((((...))))|||.{{..(((((((.(((,...,))).)))))))..}}.}}},,.|,|{{,{..,{{{..............(((((((((((((......(((((,.....((((((.(.(..((.(((((((((.(((......)))....,(({,.((((..((({{((((((..((....))..)))))))))).)))),})),......,}(((((((((((((((........))))}........,,,...,,}..,,(((((((((.((((((...)))))).((({....})))(((..(.(.((((((((....))))))))...}.)..)))...(((((.(((.....(({...)))...))).)))))...(((((((((....(((((.,(((,.((((,(((,.((((..((((,....,)),))..)))))}|||||..|||..((((({({{,....{{,{{....})})).)})))))))))}{(((({....}))))}{.((((((.{,{(({,..,,)))))))))))}|..},,,)))}..,.)))))....)))))))))..))))))))){(((({...(((.((,{(((((((((((....))))),,(((.......)))(((.((((..((((((..,{..((((...))))),))))))..)))).)))....{((((((....))))))){(.((((.(((.....))).)))))),(((((((......)))))))...})))))))).))).((((........))))...(((({......))))){(((((((.,,,(.(((((((((.((((.,,((((.((...,{{.||{,|{||...{((,,((({{,..((((((((((.{(,((.{{{.((({,((.((((,((({,....,,,,...,,})))}.}})}.}}}..||.{(((((((,{((.,,...........},))))))))))}{(({....}))|||....,)),))),||,}.}...}))))))))),.,...)))..))),....)))}.})))).,,,,)},))))...)))).)))))},))).).}},.))))))))))))},))))))))))))))))))).))..).})))))),,..((((((((..((((((.((((.(((.((((..(((....)))))))..))).))))..(((((.((((..(.................)..)))).)))))))))))..)))))))).,,....},.((.(((((((((({....})))))))))).)).........,,,,((((((((.......))))).))).})),))))).....)))))))..))))))..,,,..,{{......,,.{{{||,.,||{|{,.(((((.....))))).}},})}}}),,)))}),))..}})))}....))))),.)))))))))).)),,)).,}},))))))|||||{{.},.{||.}},}}},}}))).,.,}}})}}.}))))))...(((((((.(((((.(((.......((((((.....))))))........))).))))).)))))))}))))))))
Forensic Context

No forensic context available.