Basic Information

Symbol
hsa_chr17_0441300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-POLR2A_0022
Host gene
POLR2A
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
17:7404907-7406494 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:7501588-7503175 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-195.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -208.33 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 146.38
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((.(((((((.(.(((....))))))))..(((((...))))).((((((((((.((....(((((((.....))))))).(((((((((((...))))..))..))))).......((((((..((.......(((((...)))))))..)))))).)).))))))))))..((((..(((((.(((((((((((.(((((..((((.(((((..(((((..((((((....))))))....((..((((((((....)))))).)))).(((((((....(((((.(.((.........)).).))))))))))))..((((..((.(((....)))))..)))).))))).))))).)))))))))....)))))..))))))....((((((.(((.(((((((...(((....((...(((..(.(((..(((((((....)))))))))).)..)))....))...))))))...))))))).)))))))))))....)))).((((((.((((......)))).))))))...))))))))(((.(........).)))..)(((.(((((..((....))..)))))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(((({{((({(((.(.(((....)))})})),.{((((...))))}.((((((((((.{{....{((((((.....))))))}.{{{{{{(((((,,.}||}......}}|||...|||{{|,,(({.{....,))}|||||,.,))))),|,,}}})))})).))))))))))..{(((,.((({(,((((({(({{{.(((((..((((.(((((..(((((..((((((....}))))),.,,||..{{((((((....)))))).)}},.(((((({,{{{{{{,({(.((.........))}),},))))))))))..((((..((.(((....)))))..)))).))))).))))).)))))))))....))})),,)))})),...((((((.(({,(((((((,..((,...,{,,..(((..{.(((..(((((((....)))))))))).}..))).||,,,..,))))))...))))))).)))))),))))....}}}|.{{{{{{.{{{{..,,,,|}}}.}}}})),},)))))))){{{.{....,..,|{||,,,|(({.{{{{{,}||,...))}})}})}..}}}
Forensic Context

No forensic context available.