Basic Information
Symbol
hsa_chr17_0445100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-POLR2A_0016
Host gene
POLR2A
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
17:7417370-7417722
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
17:7514053-7514405
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-134.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-139.94 kcal/mol
Frequency:
0.0003
Diversity:
34.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((....)).)((((.(.(((....(((((....((....))..))))).((((....))))..........(((((.........)).)))....((((.(((.(((((.((.((.(((..(((.((((((((.(((((...((((((((..(..((((.....))).)..)..))))))...)).))))).))))).))))))((.((((.((((((.((((((((((((((((...((.(.((((((.((((...)))).))...)))).).)).))).)))))))).))))).)).....))))..)))).)).))).)).)))))))))).)))).))).).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((....)).)((((.(.(({....(((((..{.,{....)),.))))).((((....))))..........(((((.......,.)).)))..,.((((.(((.(((((.({.((.(((..(((.((((((((.((((({.,{{((((((..(..((((.....))).)..)..))))))...),,))))).))))).))))))((.((((.((((((.((((((((((((((((,{{({...((((((.((((...}))).))...))))})},).))).)))))))).))))).)).....))))..)))).)).))).)).}))))))))).)))).))).).))).)
Forensic Context
No forensic context available.