Basic Information

Symbol
hsa_PPP1R12A_0005700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0099295 hsa_circPPP1R12A_016 hsa-PPP1R12A_0052
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:80187643-80215970 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79793863-79822190 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-397.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -430.93 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 467.62
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((......)))((..(((.(((((((.......((((..(..((((....))))..)..))))......))))))).))).((.....))((((..(((..(((((.(((((...((((((............((((((((((((......)))((((........))))....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...)))))))...........))))))...........((((..((.((((((.(((.((..((((............(((........)))....((((...)))).................(((((((((((((....................((((.(((((.((((.(((((((((....((((.....))))....((((........))))...........................)))))))))....((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...))))))).......)))).))).))))))....((((......))))((((((((((((...(((((.....(((..((.((.((.........)).)).)).))).....))))).))))))))))))...........((((..(((((((...((...((((..((((.....)))))))).....))..........((((((((((((..((((....................((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))))))...))))).............(((.((((.....((((((.((((...........)))).))))))((((((((...........(((((.(((...(((((..............))))).))))))))...(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......)))))))))..)))))))))))))))......))))))).......)))))))))))))).))))...)))))))))))))))))..))))))))).))))..)))))))))))).))....)))...))))...........((((((...............(((.((((((((......(......)......)))))))).)))................((..(..((((((((..........(((.....(((..(((((.......................................................(((((......(((((.....))))).......((....)))))))....(.(((((((...........))))))).)..........)))))..))).....)))..((((((((.((((......(((((((.......(((((((((((...((((...........)))))))).)))))))....)))))))((((..............................))))...)))).))))))))......(((....((....))....)))...........))))))))..)..)).............))))))....(((((((.(((((((..(......(((.(((...((........))....)))..))).......)..))))....))).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((......)))((,{(((,(((((((,..,,,,({{(,{(..,{{(,{{||,|||,|,.,},.......}}||}}|,|,|,((,....,,{|||.......}}||||||,.{{,.,{{{,(,,{.....,|,.((((((((((((......)))((((.......,)),}....)))))))))..(((((((..(((((.....)))))...)))))))..,........}}}|,|.........,..||...,..{{,{{{{(({.,({,(({,,{{...,,,..,(((......,.)))|...,{{{{{||||...,,,............,,||}})))))},..,,..,}.,,,,.})))),||,|.,.{(({(({,.,,,||||||}....,.|||.,,|||||...{(((........)))).|||||,,{,,,.....{{.,,,.{{,|,||||.|.....((((((.,.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).......,}}|}))).})))}}.,,|||{{...,{.||||.(((...(((((((((.........(((.((((((((((.(((.((.{(((({..{{(((...(((,((((((((((((.....)))))}..,))))...}}.}))...)),,}}})))},),},.))).))))))..................(((((((..{{{,.{.{{,,,{{,..........,,..{|||||..((,{{.((((.....)))).}}.})..}}}}}}.,|{{{{,|,,,.}}}}........{{{.{{{{.....{(((((.((((...........)))).)))))|((((((((....{,,,...,{,,..,,,...(((({...,))))...,,,}|,.......},,....(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,}.,),,,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..)))))))))..))))))))))))))),.....}}}}}},.......)))))))...((((,{(((...{{....))..,))))))))))))))).....((((((((((..(((((..((...))..)))))............{{((((((............))))}}.,,}}...})}})))))))......))))))))).))).)))).},........((..(..((((((((..........,.|..,..,,...,{,,,.............,.........................................(((((......(((((.....)))))........,....}}))))).,{{(.,.{({((,.,,{..{,.,},},,,,})..,}}.}},.}}))}.}))).....|||{.((((((((.(((({{.,,.{((((((.......(((((((((((...{{{{...........}})})))).)))))))....))))))}{(((...,,,.......................,)})),...,}).))))))))....,.,||,,..{,....,,....}}}...,,......))))))))..)..))...,,{..........))).,.,|||{{((,{{(({{{.,{....,.|||.||{...{{..............}}},,))),,....,)..)))}....,,..}}}})))))
Forensic Context

No forensic context available.