Basic Information
Symbol
hsa_PPP1R12A_0018700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0027672
hsa_circPPP1R12A_003
hsa-PPP1R12A_0096
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:80266588-80328731
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79872808-79934951
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-132.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-137.51 kcal/mol
Frequency:
0.0001
Diversity:
50.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((.(((((..(((..((((....(((((..((((..((((.((((((.(((.((((......))))..)))..)))..((.((((((((..((.(((.(((.(((((((((((((((...((((..(((....)))..))))))))).))))).)))).).))).))).)....)..))))))))))..))).))))..)))).))))).)))).....(((((...))).))..))).))))))))(((((.....((((((....)))))).....)))))...(((((...))))).....((((.((((((.((.(((........))).))((((((((.....((....)).....)))).))))))))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((.(((((,,({{..({((,...(((((..((((..((((.((((((.(((.((((......))))..)))..)))..((.((((((((..((.(((.(((.(((((((((((((((...((((..(((....)))..))))))))),})))).)))).).))).))).}....)..))))))))))..))).))))..)))).))))).)})).....(((({...})).))..))).))))))))(((((.....((((((....)))))).....)))))...{((((...}}}},..,,,((,{{((((({.((.(((........))).)|((((((((.....((....)).....)))).))))))))))))))...
Forensic Context
No forensic context available.