Basic Information

Symbol
hsa_PPP1R12A_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP1R12A_0162
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
12:80177139-80178547 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79783359-79784767 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-402.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -429.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 295.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((((((((((((..(((..(((((((((.((.((((....(((((((((((.((((..(((.(((((((((((.(((((((.(((((((((.(((.(((((..(((.((...(((.((((((..........((((((........((((....(.((((((.(((.(((.....))).))).))((........)).....(((.((((((....(((((((((((((...((((((((((.......((((....((((((((..((...((((((((((((..(((((((...(((((.....(((((...(((.(((((...((((((((((((((........))))))).))))))).))))))))))))))))))......)))))))(((((.((((((((((.((((........))))..))))))..)))).)))))...((.(((((.((.....))))))).))......(((((........)))))..........(((((......(((((...))))))))))(((((((...((((((.......)))))).......))))))))))).))))))))....))..))))))))...))))........((((((......)))))).((((((...(((((((........))))))).)))))))))))))))).........))))))..))).........((((..((((.((((((..((.((....)).))))))))..))))....))))...(((((((..............)))))))...........))))....)))))))))...((((((((((((...((((((((((((((((((.((((((...(((.(((.......(((......)))......((((((....((((.....((((....)))).....))))..))))))...((((........))))(((((((...........)))))))........))))))...))))))...)))))))).........(((((...........)))))....)))))....))))).....((((((((.((((.(((...((((..........))))....))))))).)))))))).....((((((....)))))).....))))))).)))))....(((((..((((..((((......)))).))))..))))).........)))).)....))))))))))...(((((....)))))..)))))).)))...)))))..))..))).))).))))))))).)))))))))))))))))).)))..)))).)))))))))))....)))).)).)))))))))..)))..)))))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{((((((((((((..(((..(((((((((.((.((((..,.(((((((((((.((((..(((.((((((((((,,(((((((.(((((((((.(((.(((,(({((,..{{{.((({(({({{.{{,,,,...((((((........(((({{{{{.((((((.(((.(((.....))).))).))((........)).....(((.((((((.,..((((({{((((((..,((((((((({......,((((....((((((((..((...((((((((((({..{(((((({,.(((((.....(((({..,{{(.(((((...((((((((((((((........)))))))}}}))))},))))))}}))))))))))...,,,)))))))(((((.((((((((((.((((........))))..))))))..)))).)))))|{{({,({{{{.((.....}}))))|||||,,...,{,,{.,.,.,,,)))},....,,....(({{{..,..{{{{{{...))))}))))){((((((...((((((.......)))))).......)))))},)))).))))))))....))..))))))))...)))}.,......((((((......)))))).((((((...(((((((........))))))).))))))))))))))))....,,...)))))}.,|||{{.....}},.,,..,,|{.{(((((..{{.((...,),.)})))))),{||.....,}),.,{{((((({{............,,))))))).........,.))))..,.)))))))))...((((((((((((...(((((({((((({{{(((.((({{(,,,(({{((({..,{{{(((,.,,.{{{{({..,,{(((({....{|||,,...((((....)))).,...,}}},,))))}}..,{{{{........||,,(((((((...........)))))))..,,....,,.,,),..}}}}}),,,))})))}),........{{{{{...,,,,,...))))).}..)}}},,..,})))},((((((......))))))},{{{{((({...}}))))}}.,,,..|}}}},}}})))}}|,......((((((....)))))).....))))))).))))).{{{(((((..((((..((((......)))).))))..))))}.}},.....})))}),,..))))))))))...|{{{{,,,,))}}),,)))))).})}..}))))....}..))).))).))))))))).)))))))))))))))))).)))..)))).))))))))))).,..)))).)).)))))))))..)))..))))))},)))))}
Forensic Context

No forensic context available.