Basic Information

Symbol
hsa_PPP1R12A_0002600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP1R12A_0173
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:80180154-80211298 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79786374-79817518 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-392.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -423.83 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 346.32
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.......(((((((((((((....................((((.(((((.((((.(((((((((....((((.....))))....((((........))))...........................)))))))))....((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...))))))).......)))).))).))))))....((((......))))((((((((((((...(((((.....(((..((.((.((.........)).)).)).))).....))))).))))))))))))...........((((..(((((((...((...((((..((((.....)))))))).....))..........((((((((((((..((((....................((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))))))...))))).............(((.((((.....((((((.((((...........)))).))))))((((((((...........(((((.(((...(((((..............))))).))))))))...(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......)))))))))..)))))))))))))))......))))))).......)))))))))))))).))))...))))))))))))).(((.............)))((((((((..(((((..((...))..)))))...........((((((...............(((.((((((((......(......)......)))))))).)))................((..(..((((((((..........(((.....(((..(((((.......................................................(((((......(((((.....))))).......((....)))))))....(.(((((((...........))))))).)..........)))))..))).....)))..((((((((.((((......(((((((.......(((((((((((...((((...........)))))))).)))))))....)))))))((((..............................))))...)))).))))))))......(((....((....))....)))...........))))))))..)..)).............))))))))))))))((((((((.(.(((......))).).))))))))............(((.....(((((.(((((((....................))))))).))))).....))).(((((((.......)))))))((((.....)))).))))((((((.(((.((..(((((.((((..(((((((..((..(.((((..(((.....)))....)))).)..))...))...)))))..)))).))))).))..(((((((((...(((...(((((......))))).)))...........(((.((...)).))).......)))))))))..))).))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.......(((((((((((((....................((((.{{(((.((((,(((((((((....{{{{.....|}|}....((((........))))......,..........||......,.)))))))))....((((((.,.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).......)))).))).))))))...,((((......))))|(((((((((((...({{{{.....(({.{((.(({((...,,..,.)}|||,},,|||....,)))}}.})))))))))),.....,,....((((..(((((((...{{...((((..((((.....)))))))).....}}..........(((((({,.{{{,.{.{(,,{{{...........,,..{{((((..((,{{.((((.....)))).}}.})..}}}}}}.,|{{{{,|,,,.}}}}........,{{.{{{{,,...{(((((.((((...........)))).)))))|((((((((....{,,,...,{,,..,,,...(((({...,))))...,,,}|,.......},,....(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,}.,),,,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..)))))))))..))))))))))))))),.....}}}}}},.......)))))))))))))).))))...))))))))))))).{{{.....,,||....,||((((((((..(((((..((...))..)))))...........{(((((...............(((.((((((((..,,..{..,,,.}......)))))))).))).,}},...........((..(..((((((((..........,.{.....,,,..{{,,,.............,.........................................(((((......(((((.....)))))........,....}}))))).,{{(.,.{({((,.,,,..{{.,},,,.,,,)..,}}.}}}.}})),.}))).....|||{.((((((((.(((({{.,,.{((((((.......(((((((((((...{{{{...........}})})))).)))))))....))))))}{(((...,,,.......................,)})),...}}).))))))))....,.,||,,..{,....,,....,}}...,,......))))))))..)..)).............)))))))))))))){(((((((.(.(((......))).).)))))))}............(((.....(((((.(((((((.....{........}.....))))))).))))).....))).(((((((.......))))))){{{{,...})))).))))((((((.(({,{,..(((((.((((..((((({(..{(....((((.,(((.....))).,..)))).,...}...})..,)))))..)))).))))).}...(((((((((...,{,...(((((......))))).|||........,.}|{,.,,...},.}},....,,.)))))))))..))).))))))
Forensic Context

No forensic context available.