Basic Information

Symbol
hsa_PPP1R12A_0007200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP1R12A_0164
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
12:80190297-80203790 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79796517-79810010 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-320.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -352.99 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 288.72
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.((((.((((.......((((((.(.........).))))))...((((((((((.((...)).)))...)))))))...........)))).))))((....)).....((.((((.(((...(((((((((.........(((.((((((((((.(((.((.((((((..(((((...(((.((((((((((((.....))))))...))))...)).)))...)).))))))).)).)).))).))))))..................((((((((((((..((((....................((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))))))...))))).............(((.((((.....((((((.((((...........)))).))))))((((((((...........(((((.(((...(((((..............))))).))))))))...(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......)))))))))..)))))))))))))))......))))))).......)))))))...(((((.(((...((....))...))))))))))))))).....((((((((((..(((((..((...))..)))))..............((((((............))))))........))).)))))))......))))))))).))).)))).))........))))).(((.(((((.(........))))))..((..(((((((...((((((((((((....(((................................(((((......(((((.....))))).......((....))))))).((((....(.(((.(((..((.........))..))).))).).....)))).....)))..)))))))...)))))....(((((((.......(((((((((((...((((...........)))))))).)))))))....))))))).(((((((((.............(((((.((((((((.....................)))))))).)))))....)))))))))...(((((....(((((.....(((((((((.((((......))))...((.(.((((.((.(((((...((.........)).))))))))))).).))............................)))))))))......)))))....)))))...............))))))).)).......(((.....)))........))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
{((((.((((.((((.,.....((((((.,.........).))))},...((((((((((.({...}).)))...))))))).........,.)))).)))){{....}}{,...{(.((((.(((...(((((((((.........(((.((((((((((.(((.((.{(((((..{((((...(((.((((((((((((.....)))))}..,))))...)).)))...))},))))))}.).}}.))).))))))..................(((((((..{{{,.{.{{,,{{{,..........,,..{{{{{{..((.{{.((((.....)))).}}.})..}}}}}}.,|{{{{}|,,,.}}}}........{{{.{{{{.....{(((((.((((...........)))).)))))|((((((((....{,,,...,{,,..,,,...(((({...,))))...,,,}|,.......},,....(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,}.,),,,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..)))))))))..))))))))))))))),.....}}}}}},.......)))))))...(((({{(((...((....))...))))))))))))))).....((((((((((..(((((..((...))..)))))............,,((((((............)))))}...,,...)))))))))))......))))))))).))).)))).)}........))))}.({{,(((((.,........})))))..,,..(((((((....,,,..,{(((....,{{{,..........{{(((((...(((((...((.(((((......(((((.....))))).............||,{,,,.{(((.,.{(,{({.,,{,,{{.||,,....))..))),)}}.|.,,..)))}....))))).)).)))))..))))).}}.,(((((..........)))}}},.((((((....(((((((..,..{{{.(((((({.......)))))))(((((((((.{,....{(((({.,,(({(,((({,{,,,..,....,}}.....,.}))),.))))))....,,.))))))))){((((....))))}.........,..,,{,..((({......)))).|||{.|.((((.((,(((((...{{.........}}.))))))))))).).,.,,}}.............,},.,.)))))))..)))))).......}}}}}....)))....,)),.......))))))).},.......,,{,,...}}}......},})).
Forensic Context

No forensic context available.