Basic Information

Symbol
hsa_PPP1R12A_0007400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP1R12A_0178
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:80190562-80201110 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79796782-79807330 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-195.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -213.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 164.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))))...(((.((((((((((...........(((((((...((((((.((((...........)))).))))))((((((((...........(((((.(((...(((((..............))))).))))))))...(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((((.((((((((((...(.((((((................))))))))))))))).)).))...........((((......)))).((((((.((....))))))))......)))))))))..)))))))))))))))....(((((((.....((.(((.((...............)).))))))))))))......(.((((((....((((((((((..(((((..((...))..)))))..............((((((............))))))........))).))))))).......)))))).)....)))))))...........))))..))).))).)))....(((.((((........(.(((((..((...((((((....(((................................(((((......(((((.....))))).......((....))))))).((((....(.(((.(((..((.........))..))).))).).....)))).....)))..))))))))..))))).)........)))).)))(((((((((((...((((...........)))))))).))))))).((((((.......)))))).......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((..((.((.((((.....)))).)).))..))))}}..,(((.((((((((((...........(((((((...((((((.((((...........)))).)))))|((((((((....{,,,...,{,,..,,,...(((({...,))))...,,,}|,.......},,....(((((((.((((((.....))))))((((........)))).............(((((((((,{,((((((((((...(.((({{{,,.............,))))))})))))))).,}.,),,,,..,,...((((......)))).{(({((,((....}}}))))),,,,..)))))))))..))))))))))))))),...((((((({....,,.,((.{({...........,},,..}}),))))))))......,.((((((....((((((((((..(((((..((...))..)))))............,,((((((............)))))}..,}}...})))))))))).......)))))),}....)))))))...........)))}..)))}})).))),...{{{.{{{{.......,{.{({{,..{,..,((((((....(((................................(((((......(((((.....))))).......,,....},))))).((((...{(,(({.{{{..({.,,......})..})).))}.,.}},.)))).....)))..)))))))}..))))).,..{,,,{,|}}}.}}}(((((((((((...{{{{...........}})})))).))))))).{{{|||}}},.||),)))),......................
Forensic Context

No forensic context available.