Basic Information

Symbol
hsa_PPP1R12A_0010300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP1R12A_0136
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
12:80200115-80201005 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79806335-79807225 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-192.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -209.24 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 172.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.