Basic Information
Symbol
hsa_PPP1R12A_0019500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP1R12A_0039
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
12:80317747-80318318
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79923967-79924538
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-168.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-180.98 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
152.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....)))...)(..((((((.((.((((((((((((((.(((...((((.((((((((((((((...(((((((((((((...((((((...((((((((((((....((((..(.((((((((((.((.((((((((((((..((((((....)))))).(((((((...........((((((...(((((((.(((.....(((((.................)))))...)))((((......))))......)))))))..)))))).......((((.....))))(((((..((.....))..))))).))))))).....((((((........)))))).....((((((..........))))))..............)))))))..((((.(((((((((....))))))))).))))))))).))..))))...)))))).)..))))..))))))))))))...............))))))...)))))))))))))...)))))))))))))).))))...))).))))))))))).))).))))))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,{,....,,,...)(..((((({,((.((((((((((((((.(((...((((.((((((((((((((...(((((((((((((...((((((.,.(({(((((((((..{,((,(,,{,{((|{{,((({(({((((...})))}|{(((((..{{(({.......,{({,..,,,......,,}}}}}..}})}}||,{((,.{{{{{{((,{{,.,,..{{{{{{,.|||||,,,,.,{{{{......})))}..{,,,.,}}},..,,|||{(({.,..((((.....))))..,,.)))}..,,.||,,{{||{,|,,,}||,,...,,,,||..,.}}}}))),,),..,,,.}}}},,)}}}},.,})))),..,}}|,,,.....,||,|{{{.((((.(((((((((....))))))))).)))))))),.},.....,.|||||}}}.},}))),.)))))))))})))...............))))))...)))))))))))))...)))))))))))))).))))...))).))))))))))))}}).))))))))..)
Forensic Context
No forensic context available.