Basic Information

Symbol
hsa_RP11-530C5.1_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP1R12A_0201
Host gene
PPP1R12A
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
12:80172131-80192357 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:79778351-79798577 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-260.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -286.30 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 238.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....((((((((((((((..((......))....)))))))))))))).((((((((.((((((((..(((((.(((....((((((.(((((((((((.....((((((.((((((((.....((((........)))).....))))))))(((..(((((((.((...(((((((((((......)))))))...)))).......((((((((((((((...........((((.....))))..................((((..(.(((((((......((((((...((((((.((((..((..((.((.((((((((.....(((((.(((.........))).))))).(((((((((..........(((((((((..((((((....((((....))))....)))).)).....)))))).)))..)))).)))))......)))..))))).)).))..))...)).)).))))))))))))(((.....))).....))))))).)..)))).....)))))).))))))))(((((..((((.......)))).)))))...............)).)))))))..)))(((((((...(((......)))...))))))).((....)).((((..............))))......))))))))))).)))))).))))))((((..(((..((.((((.((((((((.((((((.((........((((((..(((((((((((((...))))).)))))))).(((((.(.((((((((...........))))...))))).))))).))))))........)).)))))).)))))))).)))).))..)))..)))).....(((((((.......)))))))((((.......((((.((((((......((........))....))))))))))....))))....................))).))))))))))))))))))))).............................((((..(((((((.((((........................(((.(((((((((.......(((.....)))))))))))).))))))).))))))).))))))(((((((((.((.(((((..((...))..))))).)).)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({.....((((((((((((((..((......))....)))))))))))))}.(((((((((((((((((..(((((.(((.,,.((((((.(((({{((((({....((((((.((((((((.....(((,{{,...,})))).....)))))))){((..(((((((.{{...,.,,(((((((......)))))))....(((((({...........(((.,.....,.....)))))}}...,,...........,,,,.....((((..{.(((((((.....{((((((...((((((.(({{..,,.,((.({.{(({{,{{.....{{{{{.{{{,{.,,.||.|||.||}||.(((((((((..........(((((((((..((((((....((((....))))....)))).)).....))))))},))..)))).))))).........,.})))).)).)).,))...)).)).))))))))))))|{{.....))}.....))))))).}..)))).....|,||,|,|||}}||}(((((..((((.......)))).))))).,,..,,,}).}...)).)))))))..))|(((((((...(((......)))...))))))).,{....|.,(({{..............))}}......))))))})))),)))))).)))))).,,...,,{.,({.((({.((((((((.((((({.({........{{{{{,..(((((((((((((...)))))}}})))))).{((((,,.(((({({(...,.......}))},..})))..))))}.}))}))..,.....)).)))))).)))))))).)))).))..||{{..((((..{{(((((((.......))))))){(((.......(((,{((((((......{(........}}....))))))))))....)))).........}}}}..)},,.))).)))))))))))))))))))))......................{{(({{{((,,...{||.|||||||...........,|,,....}}},.,{{.|{(((((({.......(((.....))))))))))}|,|||{.|,...}}..)})))})}{{{{{{{{,.,..(((((..{{...,}..))))).,),)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.