ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_PPP2R5A_0007800
Basic Information
Symbol
hsa_PPP2R5A_0007800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0016396
hsa_circPPP2R5A_013
Host gene
PPP2R5A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:212519145-212530018
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:212345803-212356676
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-92.50
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-100.32
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
62.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((...)))((((((......((((.(((........).))))))((((..(((((((((..((........))..........(((.(((((((.(((((.(((((....................(((.((....)).)))..(((((((((.....)))))).))).(((((((((....)))))))))....(((.((((........)))).))).................))))).))))).))))))).)))..((((...))))......((((((..((.....))..))))))......((((((((...(((.....)))...))))))))...))))).))))..))))..((((((.(...((((.....)))).).))))))..))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(((...)))((((((......((((.((,,.......}.))))))((((..(((((((((..((,......,})|,....,,..(((.(((((((.(((((.(((((....................,,,.{{,,.....|}}..{{{{{{{{{.....)))))).))).(((((((((....)))))))))....(((.((((........)))).))).................))))).))))).))))))).)))..((({...})))..,,,.{(((((..((.....))..)))))),.....((((((((...(((.....)))...))))))))...)))))},)))..))))..((((((.,...{(({.....))),.,.))))))..))))))
Forensic Context
No forensic context available.