Basic Information

Symbol
hsa_PPP2R5A_0008100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP2R5A_0050
Host gene
PPP2R5A
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
1:212519276-212520688 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:212345934-212347346 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-335.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -362.34 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 434.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((.((......((((...)))).....................((((....))))...............(((((((...)))))))(((((((((((......((((((((((((((((((.((((.....(((......))).....))))))..)))...)))........))).)))))))...)).))))))))).((((((((......)))))))))))))))).)((((.(((.((((((((((((((((((((((.....))))))))(((((((((((.((((((((((((.(((((.......))))).)))))))))))).)))).))))))).(((((((((...)))))))))..((((((..(((((..........)))))))).))).......(((((((......((....(((((.((((.(((...))))))).)))))....)))))))))((((...))))((((.((((.......(((((.(((((((...((((((((((...(((.(((((.......(((((....((((...((....))...))))....)))))))))).))).))))))))))..))))))).)))))......)))).)))).....((((((....))))))...((((((((((((((...((((.((((((((..((((....((((........................(((..(((((((((....((((((....((((....(((((.(((.((.......))..)))))))).....))))...))))))((((.....((........))....))))......(((((..(.(((.....))))..)))))((((((...........(((....)))...)))))).....................(((((((....(((((((((...((((((...))))))....((((((((((((..(((.((((....(((((((((...........))))))))).....)))).)))..).((((((.....(((....)))....))))))...(((.((((((((((.......((((.((((((..(((((((......((((........)))).........(((.(((((((((((...)))))).)))))...))).)))))))..)))))).)))).......)))))))))).)))...))))))))))))))))))))........))))))).)))))))))..))).((((((((.(((..((......))..))))))..)))))..(((.....))))))).))))..))))).....))).))))..))))))))..))))))))))))))))))))..))).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.(((((({,,......{(((...||},.......,...,,{{......{{((||,,||||...............{{(((({...))))))}(((((((((((......((((((((((((({((((.((((.....(((......))).....))))))}.,}}...)))........))).)))))))...)).))))))))).(((({(({,,..,,||}|||||||||}}}}.|((((,(((.{{{{|||{||||{{((((((((.....))))))))(((((((((((.((((((((((((.(((((.......))))).)))))))))))).))))}})))))).{{{((((((...))))))))),|||||}||}..||,|}.}}||.,(((((((((,(({(......))))|,.......)))))).}})|.{(((,(((...))))))}{{{.....)}),|||||,(((((...))))),,{,{{{{{......{{{{{.{{{{(((,,,(((((((({{...{({.{{{{,......{(((((....((({...((....))...})))....)))))))))),))),)))))}}|||,,}}}}}}),)))}}...,,,|,,,.}}}},....{(((({....}))))|,{{|{{|{{|{|||}||,}},||},.}},.,,,}}|,}}}..,}))}},.|||||,,...},,,}},,,..(((..(((((((((((((((((.(((..(({{{((((,(((.,,(,,..,,..,|||,,||,|}|||.....,,,}||{{|,,,((((,....,{({{{{{..,{,|..{|||,..}}}}{{|{|}.{}|||,,...))))..})))}((({((......,...,{{{....}}}...,,}}},...,,||,,,,....,,,,..,{{{.,,..,.,,,{,,,,,...(((((,...}))))).,..{{{{||||{,,{{,,{{,({((,...{{{{|||{|.|,,,..,..,}))}))))).....)))}.}}}....,|||||,,.,.{{{....})}...,}}}},,...||{,((((((((((.......((((.((((((..(((((((..,...{{{{,,,,....}}))..}}.....{({.(((((((((({...}))))).)))))...))).)))))))..)))))).))))....,..)))))))))).}}}{{{|,,,,))))})),))))))))..))))))))))))..))))))))..))).{{{({(((.(({.,{|,,....,,,,)))))}.,))))),,|{{.....))}....,}.))}})......,||||,.|(|{{{,,,,{{,,,.||..}}}}}}))))})))}},,))),))))
Forensic Context

No forensic context available.