Basic Information

Symbol
hsa_chr1_0542600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PPP2R5A_0082
Host gene
PPP2R5A
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:212527188-212528179 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:212353846-212354837 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-296.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -314.03 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 178.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(..((((..(((((....((((((...........((((....)))).....((((.....))))...))))))..)))))..))))..)(((.((................(((((((.((..(.((((((.((((((...((((...(((((((..((..(((((((((.(((((((((((((((....(((.((..((..(((.(((...)))))).))..))..)))....))))).))))....((((((..(....)..))))))..(((.(((((((((((.......))))..........(((((((.....))))))).(((......))).((((.(((((((........)).)))))...)))).......((((.((((((((((((......))))).....(((.((.(((....))).)))))....(((((.....)))))((((((.((....)).))))))))))))).))))))))))).)))))))))..).))))))))..)))))))))...))))..........((((((..(....)..))))))....(((((((((((......))...)).)))))))((((.....)))).((((((...........................((((((((...)))))))).((.((((.(((((((((((((.((....)))).)))))))..))))))))...))((((..(((((((....((....)).....)))))))..)))).))))))....(((....)))...(((((............))))).(((.((((...((((.(.(((((...((((.(...).)))).))))))..))))....)))).))))))))))))))).)..))(((.(((((((((.(((.........))).)).))))))).)))....))))))).....((((((....).)))))....)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{..((((..(((({....((((({,....,.....{{{,....}}}......((((.....))))...})))))..}))))..))))..}{{(.{,................(((((((.{{..{.{(((((.((((((...((((...(((((((..((..(((((((({.(((((((((((((((..{.(((.((..((..(((.{,,...,},))).))..))..))).}..))))).))))..,,((((((.,(....}..}))))),.{((.((((({{,(({,,,...,||||,.........{((((((.....))))))}.((((..{{(,|,{(,,(,(((((((........)).)))))}..)),,}}}.}}}}.,{,,(((({{,{|||,.,,,.})))).....{{{,((.{{{..,,))),))))},...(((((.....)))))((((((.((....)).))))))))))))).)))}))))))).)))))))))..},}))))))).,)))))))))...))))..........((((((..(....)..))))))....((((((({(({......,,..,}),)))))))((((.....)))).((((({........................,,,((((((((...)))))))),(({((((.(((((((((((((.((....)))).)))))))..))))))))...))||{(..(((((((....((....}}.....))))))).,))),.}))))),...|||....)))...(((((............))))).(((.((((...((((.{.(((((...((((.(...}.)))).))))),..))))....)))).))))))))))))))).}..))|{{.(((((((((.(((.........))).)).))))))).}}}....))))))).....((((({....}.)))))....)).)))
Forensic Context

No forensic context available.