Basic Information

Symbol
hsa_PRDM5_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0070814 hsa_circPRDM5_013 hsa-PRDM5_0016
Host gene
PRDM5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:121631464-121732604 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:120710309-120811449 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-207.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -224.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 249.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.