Basic Information

Symbol
hsa_PRDM5_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0070817 hsa_circPRDM5_009 hsa-PRDM5_0014
Host gene
PRDM5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:121675708-121737729 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:120754553-120816574 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-213.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -230.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 230.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((....((((.(.(((....((((((((..((((((.(.((((((((.....((((((...((.((((((((((((((....))).....((((.........))))(((((((((.((..((((......)))).)).)))))))))..........))))))))))).))....))))))(((.(((((....((((((..((.(((((...))))).)).))))))....))))))))((((....)))).....(((....)))((((((((..((....(((.(((....(((.((((((((...)))))))).))).))).))).)).)))))))).(((((((((....((.....(((......))).....))...)))))))))...(((.....)))(((....)))(((((....(((((....(((...((((....))))...)))....)))))....))))))))))))).)))))))....(((((....)))))((((((......(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..)))...((((...))))..((((((((...))))....))))..(((((((......(((.....((((((((((((((.....((......)).....))))))))...))))))....))).................((((((...(((....((((.((((...)))).))))....(((((....)))))..)))....)))...))).))))))).)))))).))))))))..)))).))))..))))..))))((....((((..((((.((...........))))))..))))....))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..(({{....{(({.{,(((....((((((((((,.((((((((...((((({.,,((((((...((.(((((((((((.{{,,..((((.........))))....,}}}|((((((((.((..((((......)))).)).))))))))}..........))))))))))).))...}),)))){{,.{({{{....((((((,.({.{((({...)))}).)).))))))....})))))))||||..,,)))).....,{{...,||,((((((((..{{....{({.(({....{((.((((((({...}))))))).))},))),))}.}}.)))))))).|((((((((....,,.....(((......))).....,}...))))))))}...(((.....))),{,.,,,.|{(((((....(((((....{((...((((....))))...)))....)))))....)))))),})))|{((((({.,{{.{(((((((.{{((..((((((.....,(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..|||,{.((((,..,}}),))|,,{|||...}})},,,||.,))))))..)).}},,.(((.....(((((((((((((({,...((.....,))....,))))))))...))))))....))).................})}}}}}}}|.{,...((((.((((...}})).)))}....||||{.,,,)))}}..,,,.,,.},,...)))))))}))))))}))).))))))))..}}},,||||{.||}}..},}}||..,,{{{|..,{{|.||,|}}},,,.|,|,,,,,.,)))),,..)).,,
Forensic Context

No forensic context available.