Basic Information
Symbol
hsa_PRDM5_0005700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0125187
hsa_circPRDM5_005
hsa-PRDM5_0019
Host gene
PRDM5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:121698343-121742500
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:120777188-120821345
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-322.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-346.89 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
306.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..........(((((((((..(....)..)).)))))))...........))))(...(((((.((.(((((..(((...((((((((((((((((((..((((((.((((...))))......((((.(..((((((((((..((((((.....(((((((((.((.....))))))..)))))...((((((.......))))))...(((((......)))))((((((((....))))))))....(((((.........................)))))...........((((((..(((((((((....)))))......))))..)))))).((((.((((.(((.((.....))))).))))))))......))))))..).)))))))))).))))))))))..))))))))))...)))))...((.(((((((((....((((.(.(((...(((((((((...((((((.(.((((((((.....((((((...((.((((((((((((((....))).....((((.........))))(((((((((.((..((((......)))).)).)))))))))..........))))))))))).))....))))))(((.(((((....((((((..((.(((((...))))).)).))))))....))))))))((((....)))).....(((....)))((((((((..((....(((.(((....(((.((((((((...)))))))).))).))).))).)).)))))))).(((((((((....((.....(((......))).....))...)))))))))...(((.....)))(((....)))(((((....(((((....(((...((((....))))...)))....)))))....))))))))))))).))))))).)))))))))....))).).))))......(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..)))...(((((.....)))))...........(((((((.((..(((.(((.((.......)).))).))).)))))))))..((((((((.....)))))))).......))))))))).)).................................((((.((((...)))).))))....(((((....)))))..)))...)))..))))))))))))....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((..........{(((((({(..(....}..}}.)))))))...........)))|((..(((((.{({(((((.,(((.,.((((((((((((((((((..((((((.,{({...,},},.....((((.{..((((((((((..((((((.....(((((((((.({.....))))))..)))))...((((((.......))))))...(((((......)))))((((((({....}))))))).,,.,{({({{,,..{{{,,.......,,.....))||,,,{,,{.....((((((..(((((((((....))))),.....})))..)))))).,,,...}})))}|.}))}...||,,..,))}))))...}},))))))..)})))))))))).))))))))))..))))))))))...)))))..{((,(((({,({,.,..|,{|,|,|||}|,(((({({{(|.,((((((,{,{({{((((,,,..((((((...((.(((((((((((.{{,,..((((.........))))....,}}}|((((((((.((..((((......)))).)).))))))))}..........))))))))))).))...}),)))){{{.{{{{{....((({((,.({.{{({,...)))}),)).)}))}}....}}}}))))((((....)))).....,||...,||.((((((((..{{....{({.(({....(((.((((((({...}))))))).))},))),))}.}}.)))))))).||{{{{{({....,...,,.{{{......))}.....,}...}))))))}|...(({.....))){{{,...}}|(((((....(((((....{{{...((((....))))...})),...)))))....))))})))))))),))))}}},|,||||||{{.{{{|,.{{{|||......(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..}}},{.(((({..,,,)}))},,{|||...}})}|,,||,|)))))),,}).}},..{{{.....{{{{{{(((((((({{,..{{.....,)).....))))))))...}))))),,,,})).................,}},,,,,}}......((((.((((...)))).))))....{((((....)))))..))).,.)))},))))))))))))..}})
Forensic Context
No forensic context available.