Basic Information

Symbol
hsa_PRDM5_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRDM5_0052
Host gene
PRDM5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:121631464-121828712 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:120710309-120907557 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-450.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -482.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 409.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
........((.(((.(..(((.((((.(((....(((((((((((..(.((........)).)..)).))))((((((.((((.(((((((((.((..(((((((((((..((((((((...((((((.((((...((((.(((..(((((...(((((......))))).(((..((((((((........((((((((((....((((((.(....).))))))...))))))))))...........(......)..)))))))).)))((.(((((...(((((.(.((.(((((((((((((((..((((((.((((...))))......((((.(..((((((((((..((((((.....(((((((((.((.....))))))..)))))...((((((.......))))))...(((((......)))))((((((((....))))))))....(((((.........................)))))...........((((((..(((((((((....)))))......))))..)))))).((((.((((.(((.((.....))))).))))))))......))))))..).)))))))))).))))))))))..))))))))))...))))).)).))))....))....)))))))....)))))..))))))).)))).))).))).((((((.(((((.((...((.((((((((((((((....))).....((((.........))))(((((((((.((..((((......)))).)).)))))))))..........))))))))))).))...))...............(.((((.(((.(........).))).)))).)(((((....)))))..)))))..)))))).....(((....)))((((((((..((....(((.(((....(((.((((((((...)))))))).))).))).))).)).)))))))).(((((((((....((.....(((......))).....))...)))))))))...(((.....)))(((....))).........(((((....(((...((((....))))...)))....)))))))))))))))))))).))))..)))))))(((((....))))).(((((......(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..)))...((((...))))..((((((((...))))....))))..(((((((......(((.....((((((((((((((.....((......)).....))))))))...))))))....))).................((((((...(((....((((.((((...)))).))))....(((((....)))))..)))....)))...))).))))))).))))))))).)))))))))).((((((.........))))))(((((...........))))).......)))))...)))...)))).)))..)))).))..((.(((...((((....(((((((..((.....)))))))))......))))..))).)).(((((((((((......)))))))))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,.......((.(((.,.,(((.((((.(((....((((((((({{..(.((,,,.....||,|..||,||||({{{({,((((,({{{(((((.((..(((({((((((,.{(((((((,,.{(({((,{(((...((((.(((..(((((...((((({....|))))).(((..((((((((.......{((((((((((....((((((.(....}.))))))...)))))))),),}.........,......,..)))))))).)))((.(((((...(((((.(.((.(((((((((((((((..((((((.,{({...,},},.....((((.{..((((((((((..((((((.....(((((((((.({.....))))))..)))))...((((((.......))))))...(((((......)))))((((((({....}))))))).,,.,{({({{,,..{{{,,.......,,.....))||,,,{,,{.....((((((..(((((((((....))))),.....})))..)))))).,,,...}})))}|.}))}...||,,..,))}))))...}},))))))..)})))))))))).))))))))))..))))))))))...))))).)).}}}}....}}....)))))))....)))))..))))))).))}},)}}.))}.((((({.,{((((((...((.(((((((((((.{{,,..((((.........))))....,}}}|((((((((.((..((((......)))).)).))))))))}..........))))))))))).))...}),))}}{{,.{{{{{....((((((,.({.{((({...)))}).)).)))))}....})))))))||||..}}))))......{{,,,{((.((((((((..{{....{({.(({....(((.((((((({...}))))))).))},))),))}.}}.)))))))).}|{((((((....,,.....(((......))).....,}...)))))))||,,.(({.,,,.||},(({{..,||{{.,.....||,|,.,.,|||...{|||,.,,)))}.,,,)))}.,})))}})))))))))))))).))))..))))))).,{|||,.}}|},.,|||||.,,,..|||..((((((..(.(((....))).)..))))))..|||.{.((((,..,}}),}}|{|{|||...,}}}},,,})})}}|||{{||.||,..{{{.....,,||,,,((((((({{{.,(({{{{{,,,..}}})))))}||,,.||||||,...,}}.,,,}............|||,....,({{,...((((.((((...}))).)))}...,|||||.,,})))}},,}}}..},))),,,))},|||||||.,,})))})).)))}}}}}},.{(((((,,,,.....}}}}}}{{{{{........},,))))),......)))))...)))...)))).)))...))).))..((,(((,..{{{{..,.(((((((,.((.....)))))))))...}},))))..}}}.}).(((((((((((......))))))))))).,
Forensic Context

No forensic context available.