Basic Information

Symbol
hsa_PRDM5_0002800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRDM5_0054
Host gene
PRDM5
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
4:121652773-121733969 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:120731618-120812814 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-519.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -567.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 661.50
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((..(((....(((((((..(((((((((((((.(......).))))))))).(((((.((((((.((...........))..)))))).))))).(((((((.....(((((((.........(((((....((((((((.....((((((.....((......))..........................(((.(((....)))..)))..(((((((......(((((.((.......)).))))).....)))))))........))))))......)))))))))))))......)))))))...(((((..(((((((...)))))))..)))))....(.((((((.((((..(..((......))..)..)))).)))).)).).....((((.(((..(.((((......((((((.(((....((((.(((.((.((((((((((.(.....).)))))))))))).)))........))))))).)))))))))).)..))).)))).............(((.(((((.....))))))))..))))))).......))))..)).))))).....)))......((......))...(((((.......(((((((((((....(((...((((......))))...))).((((.((((..(((..((((((((.(((.((((.(((((((..((((.........................(((...((((((..(((((((((....(((((((..(((((..........(((((((.....(((((.((..((((((((((...(((((((.(((..........(((((((((((((((((((......))).))))((..(((((..(..(((.(((.(((........))).))).))).)..))))).))....))))))))))))......((((((.((....)).))))))..((((((.......))))))..))).)))))))..........(((((.........))))).))))))))))..))))))).(((((....)))))....(((((((((((((((((........)))))))))(((((((((...)))))))))......(((((.(((....))).)))))(((((((...((((((....))))))))))))).........((((((.....))))))......))))))))........(((((......))))).....(((((((.....))).)))))))))))((((((.....))))))..)))))..))))))).....)))))))))..))))))...))).(((((((....)))))))...)))))))))))..)))).))).......((((((((..((.....))....))))))))......((((.(((.(........).))).))))((((((.((((....))))((((....))))......))))))((.((((((((..((....(((.(((....(((.((((((((...)))))))).))).))).))).)).)))))))).))(((((((....((.....(((......))).....))...)))))))((((.((..(((.((..((((...((((.(...........).))))....)))).)))))..)).)))).))))))))..)))..)))).))))......)))))))))))......))))).))))))))(....((((((..(.(((....))).)..)))))).((((.(((((((.....))))).))))))..........(((.(((((((.((((..................((((((((...((((((((.....)))))))).(((((((.((((.......))))............((((((...(((....((((.((((...)))).))))....(((((....)))))..)))....)))...)))((((((((....))).)).)))((((((......((((((............))))))...))))))))))))).(((......)))))))))))(((((((((((((((.(((.........(((((.((((.(((......(((((.((((........)))).)))))))).))))..)))))((((.......)))).))))))))))........)))))))).(((((((...........)))))))))))))))).)).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{,,,,{,|,{{..,,{{{..,{{|{,{{(((((((((.(......).))))))))}}|((((.((((((.({...........}}..)))))).))))}.,((((((.....,,,{,,,..,,.}}},(((({...,((((((((.....((((((.....((......,}...{,,.,,,{...............{||,,||,...}}}..,,,..(((((((......(((((,((.......)).})))).....)))))))........)))))).,....)))))))))))))......}}},,,,...(((((..(((((((...)))))))..)))))....,||||{({.((((..,..((......))..|,,||}|,}||(((((({{..,(({{.,,,,,|.{,{,..{{{(((((({.(((...,{,||.(((.(({((((((((((.(.....}.))))))))))}).)))..,{|{|.{{|.|||,|}}|||||||,|..|,,.},,)||||...{{,...({{.{{{{{.....)))))))),,,))),}},,.,,})})))).}}|}},.,.,,,,{{{,...|}||.......,...(((((,.{{...(((((((((((....(((...((((......))))...))).((((.((((..(((..{(((((((.{((.((((.{{(((({.,((((...........,,{|..........,{{|,|((((((..(((((((((....((((((({{(((((,((,{{,..,(((((((.....(((((.((..((((((((((...{((((((.,,,..........(((((((((((((((((((......))).)))),{..{((({..{..(((.({(.(((........},,.))).}}}.},.}})}).)),...))))))))))))....,.((((((.((....)).)))))),,((((((.......)))))),,}}|.))))))},,....},..||||{.........}}}}}.))))))))))..))))))).{({{{....})))){,,,(({{{{{{{(({{{,{{{.,.....,||||||||{((,,,,,...}),))))))))}..,{{{{{{.{{,....,}),))))))||||||}..((((((....)))))),,,||||.........{{{(({...,,})))}|,...,,{|..,|||,.,,{{......,||||||},}})}}}}}|{|||||,,,..},,.}}},))))))),,,,|,},,,,}}}}}}}})}}}}..})))))).....}))))))))..)))))}...}}}.{((((((....))))))}...)))))})))))..)))).))}.......((((((((..((.....))....)))))))).....,{(((.(((,({,,{{...|.}}}.}}}},|{{{{.{,,.....}}}}((((....))))......||,,,|{{.((((((((..{{....{({.({{....(((.(((((((|...}))))))).))},))),))).}}.)))))))).||(((((((....,,.....(((......))).....}}...)))))))||,,.(({.,,,.||}.{{{|.,,||||.|,.,,,}}....,.,||}...,|||,.}}))),.,,.)))}.)))))))}..)))..)))).))),.,....)))))))))))....||}}}|||||},,,,,({{..((((((..(.(((....))).)..))))))..||},{.(((({..,}})}))}|}||||...,}}}|,,,{,{|||||||,|||||,..|{{.,...{(((((((((((((,,...{{.....,)).....))))))))...))))))....))).,.........,.....|||,,...|,,.....{(((.((({...)))).)))}....,(((((.(((((({,,,{{.((({{(((({,.((((((.,....(((((,((({..{(({..,{,,(({({{..........,.}}))}}...}))}))))|||{,.,,,...}}}}..)))))....,)))))).)))))))))..},}),....}))))))))))),......(((((.((((.{....,.)))).)))))}}}.,}}||{||||{{{{{.....,,)))}}},.}}}}.|||||,..,{({,.|||,.}|})))),},.}}},}},))))))})))}}}),),))),,))
Forensic Context

No forensic context available.