Basic Information
Symbol
hsa_PRDM5_0003400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRDM5_0034
Host gene
PRDM5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:121652862-121742500
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:120731707-120821345
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-455.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-489.05 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
402.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((....)))))).))(..(..(((........(((((((((((((((((((.(((...((.((((........)).))))(((((((((((((((..((((((.((((...))))......((((.(..((((((((((..((((((.....(((((((((.((.....))))))..)))))...((((((.......))))))...(((((......)))))((((((((....))))))))....(((((.........................)))))...........((((((..(((((((((....)))))......))))..)))))).((((.((((.(((.((.....))))).))))))))......))))))..).)))))))))).))))))))))..))))))))))...))))))))))))))))))))))((((((((((((((((..((((....)))))))))))))..(((((........)))))......))))))).)))))(((((((((((((((((((((((..............))))..((((((((((.......(((............)))..))))))))))...(((.....)))..))))))))))))))))))).(((.((.(((((.((((((((((...((((...((((((((..((((.(((...((.((.......))..))...)))))))......))))))))...)))).))))).....((((((((((((((....))).....((((.........))))(((((((((.((..((((......)))).)).)))))))))..........)))))))))))(((((((((....(((.(((((....((((((..((.(((((...))))).)).))))))....))))))))((((....))))....(((....(((........))).....))).........(((.((((((((...)))))))).))).)))))))))..((((((((((((((((((....((.....(((......))).....))...)))))))((((((((.((((...(((((....((((((....(((((....(((...((((....))))...)))....)))))....))))))..)))))..)))).))).)))))......))).))))))))....(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..)))...(((((.....)))))............((((((.((....))..)))))).(((.....((((((((((((((.....((......)).....))))))))...))))))....)))..............)))))))))).)).)))..((((.((((...)))).)))).....(((((.(((((((...(((((((.(((((..((((((......(((((.((((..((((......((((((............))))))...))))))))((((........))))..))))).....)))))).)))))))))....)))....)))))))))))).......(((((.((((........)))).)))))..)))..)..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
({,({{{{,....}|||||.{{(,.(..,{{{{,,.,,|{{{,(((((((((((((((.{{{..,((.{{{{...,,,..)}.}}|}(((((((((((((((..((((((.,{({...,},},.....((((.{..((((((((((..((((((.....(((((((((.({.....))))))..)))))...((((((.......))))))...(((((......)))))((((((({....}))))))).,,.,{({({{,,..{{{,,.......,,.....))||,,,{,,{.....((((((..(((((((((....))))),.....})))..)))))).,,,...}})))}|.}))}...||,,..,))}))))...}},))))))..)})))))))))).))))))))))..))))))))))...))))),))))))))))))))))|,,,,,,(((((((((..((((....)))})))))))))..(((((.,......))))),,,,..,},,})),}},,,((((((((((((((((((((({{...........,,,|||,..{{{|{|{{{|,......(((............))),||}}}}}}}}}...{{{.,,,,}}}))))))))))))))))))))),|||.{(.(((({{((((({({.{{{,{({((((,((((({,.(({{{{{{|||,,||||,},||,|},|||{||{{{...((((((.(.((((((((.,{,.((((((...((.(((((((((((.{{,,..((((.........))))....,}}}|((((((((.((..((((......)))).)).))))))))}..........))))))))))).))...}),)))){{{.{{{{{....((({((,.({.{{{{,.,.)))}),)).)}))}}....}}}}))))((((....)))).....{||...,||,((((((((..{{....{({.({{....(((.((((((({...}))))))).))},))),))}.}}.)))))))).|((((((((....,,.....(((......))).....,}...))))))))}...(((.....))){((....}}|(((({....(((({....{{{...((((....))))...})),...)))))....))))})))))))).))))))).},}||||{{{.{{({,.((((({......(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..||},{.((((,..,,})}))|,,{|||...,}}},,,||.,})))))..}).))}},||,.....{{{|||((((((((||,..{{.....,))....,))))))))...}))))),},,,),,}}}}}..,,.,..}))))))))).)).}}}..((((.((((...)))).)))).....(((((.(((((((,,.((,((({{(((({..((((((.,....(((((.((({..{(((..,{,,((((({..........,.)))))}...)))}))))|{{{,.,,....}}}}..)))))....,)))))).)))))))))..,,)),....)))))))))))).....,.(((((.{(((.{....}.)))).)))))},}}}}})},)
Forensic Context
No forensic context available.