Basic Information

Symbol
hsa_PRDM5_0004300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRDM5_0062
Host gene
PRDM5
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
4:121675708-121719579 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:120754553-120798424 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-134.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -144.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 150.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.........(((...(((((((...)))))))..((((((((.((((((((..((((((((((((((((((((....((.....(((......))).....))...)))))))((((((((.((((...(((((....((((((....(((((....(((...((((....))))...)))....)))))....))))))..)))))..)))).))).)))))......))).))))))))....(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..)))((.((((...)))).))((.((((...)))))).))..)))))..))).))))))))............((((((((...((((((((.....)))))))).(((((((.((((.......))))............((((((...(((....((((.((((...)))).))))....(((((....)))))..)))....)))...)))((((((((....))).)).)))((((((......((((((............))))))...))))))))))))).(((......))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.........(((...(((((({...}))))))..((((((((.{{{{{{{,.,{{((((((({((((((((((....,,.....(((......))).....}}...)))))))||,,.(({.{{,.||},(({{..,|{{{.,.....,,,,..,.,})),,,|)|)),,,}))}.)).})},..{((((((((,||...,.{||{...,)}}...,,,.))))))))}||}.||||||},....(((..((((((..(.(((....))).)..))))))..))),{.((((,..,}}),))|{,{{{{...}))),,.}}.,)))))).,)).)))))))).......,,...((((((((...((((((((,...,)))))))).(((((((.((((.......))))............{{{{{{..,(((....((((.((((...||||,}}},....|||||.,,,)))}}..}})....)))...)))((((((((....))).)).)))((((((..,,,,((((({..........,.)))))}...))))))))))))).{{{......))})))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.