Basic Information

Symbol
hsa_PRDM5_0011500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-PRDM5_0081
Host gene
PRDM5
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
4:121842468-121843078 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
4:120921313-120921923 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-152.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -165.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 164.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((((((((.....))))....(((((....((((((.(((((((((..........(((((...((((((((.(((..(((((((((((...........))).)).)).)))).))).)(((((..((((.((.(......).)).)))).)))))..)))))))...)))))(((((........)))))..((((.((((((((....))))))))..))))............((((((((...((((((.(((((((..(((.((...(((((.((((...))))))))).)).)))..))))..(((((....))))).))).))).)))))))))))((((.((((((((((((.((((.(((....))).))))...))))))..................))))))))))))))))).)).))))))..)))))...((.((((....(((.....)))....)))).))......((((((((...(((...)))....)))))))).......((((((............))))))..))))))).....(((((.(((......................))).))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((({(((,..,{,..}}..}|||,{..,,((((((.(((((((((..........(((((.{.((((((((.(((..(((((((((((.........,.))).)).)).)))).)}},|({{{{,,{({{|{(.,....,.,,)),)))).})))),.))))))).,.))))}(((((........)))))..,(((.((((((({....})))))))..)))|,,,....,,,,.((((((((...{{{(((.((((({(..(((,((,,.(((((.,({,...,)},))))).)),))}..))))..(((({....})))).))).))).))}))))))))(((,,(((((({(({((.,(((.{{{..,,||}.}}}}...}})))}....,,,,,,,..,,...))))))))))))))))).)).)))))),,|||},...||,||{{...,(({.....)))...,}}}}.,....,..((((((((..,(({...)))....))))))))..,,...((((({............)))))),.)))))))....,(((({..(({,...,}}}.,,,},.....,,}}}.})))).....
Forensic Context

No forensic context available.