Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0006100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0084711 hsa_circPREX2_014
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:68968065-69039654 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68055830-68127419 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-717.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -768.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 891.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..........((..(((((..((((((.(((((((((((((((.....(((((((....))))).......((..((((........))))..))....))...))))....(((.(((((((((((....(((((....))))).......((((((.((((((((.......(((((....(((((((((((..(((......(((((((......((((((((.((((.........)))).)).))))))((((((..(((......)))..))))))...........(((((((.(((((...(((((((((......((((((.((.....))))))))...)).))))))).......))))).))))))).((((((.(((((((((...........)))))..(((((((((....((((((((.((((((((((((.((((........))))....((.((((...((((((.............))))))....)))))))))))...))))))).)))))))).........)))))))))..((((((.((((.(..(((.(((((((((.((((........)))).)))....))).))).)))..).))))...))).)))......(((((((....)))))))......(((((((((..(((.((((((........)))))).))))))))))))..)))).))))))...........)))))))......(((((((((...(((((((...((((((((.((((.(((((...(((........)))((((.((((((((((((.((..(((((...))))).(((((..(((((.....))))).)))))..(((((.........((.(((((((..(((.((((.(((((((.((((((((.....(((((((.........)))).))).....)))))))).....(((((((....((((...((((..((((.(((((((.........)))))))))))))))..))))....)))))))(((((((((((.((..((.(((((((((((((..((((...(((((......))))).))))..)))))...(((((.........))))).((.......))..)))))))).)).....)).))))).))))))...)))))))..)))).)))...............((((((((((.........))))))..))))...(((....)))...))))))).)).........)))))...)).)))))))))))).)))).....))))).)))).....((((((...))))))(((((...((.(((((((......))))))).)).(((((((.(((((.......((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..)))))).....))))).)))..)))).((((((.....))))))(((((....)))))........(((((((.......(((.(((((.((((...))))))....((((.(((.....))).))))......)))))).......))))))).))))).............))))(((((.((.(((.((((...((((((..........))))))..))))...)))...)).)))))))))..)))))))...)))))))))((((((....((((((((..........(((((((...........))))))).(((((((.((.((((((((.....((..((((.....((((........)))).......))))...))......))))))))))...)))))))..........))))))))..)))))).))).))))))))))))))))....(((((((((((.....((((..(((.((((................)))).)))..))))..))))).....))))))(((((((..((.(((.((((......)))).)).).)).)))))))......(((.(((((((((((.....((...((((........)))).)))))))...)))))))))....))))))).).))))))......)))))....((((((((......)).)))))).)))))))))........(((((...)))))))))))))...........(((((.(((((((((....(((....)))...((((...((((((((..((((....((((((((((.((....)).))).)))..........))))...))))...))))))))...))))......(((((...((((....))))....)))))........((.(((.....))).))...(((((.((((........))))....((((...))))..)))))))))))))).)))))......))).))))))..)))))..))(((((((.((((.((((......((.(((((.((..((((..............))))..)).))))).)).....)))).)))).))))))).(((((...(((.((.(((.....)))...)).)))....)))))(((((.((.((((.....))))..)).))))))((((....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,,,.......{{..{{((({,((({{(,(((((({{{{(((((,.,{,{(((,{{...||||......,..{(,.((((........}))).,)}..,,}}...,}}}....||{||{{{{{{{,,,...,(((((....}))))},,|,,|{||||{,((((((((...{{(((({({{{{{{({((((,,{,.,|||.{((.((((({,,..,..,(((({{.,.((((,,,,.....}}}|,||,|||}}}{(((((..(((......)))..)))))).,.|,{,...,(((((((.(((((...{(((((({(..,,,,({({{(.{,....,)})))))}..,}},|||}}}}.......))))).)))))))|||||||{,,},}}}}},,}.}.....}}}}.}|,|{{((((((..,,({{((({{.((((((((((((.{{((,......}))))....((.((((...((((((.,.........,.))))))....})))))))))).,,}}))))).})))))),.,}...,,,)))))))},..((((((.((((.{..(((.(((({{{{{.((((,,,,....}})}.)))},,,))),))).)))..}.))))...))).)))......(((((((....)))))))......(((((((((..(((.((((((........)))))).)))))))))))),{(({{........,..........,}||||,......|||||{{,...,|||{||||.|(((({{{,{(((((({.{((((((........)))))}||(((({{{{{{((.(((,(({{{{{{((({,,(((((..({{((,,...}}})),|}}}}.,{({{,...{{{{{{(({.,,({{,..{,({(({{,,||||,,.((((((((.....(((({{(.........))},}))).....)))))))),{{{{((,{{{|}}}}||,,.}}||||}}|||||{(({({(|,|,{.,,.||||||||||}|||||{||||{{{{||||||,{{{{{{{,,,|||,||||,((((((((,,(((..((((...(((((......))))).))))..,||||...(((((.........))))).,,.}}}}..}},.)))))))).},..{{{{{{.,,,,,|||||}..,))))),,..,)))})}{{{{.{{{{{(.....{(((((((((.........))))))..)))|{,.{((....))).,,,)))))).))}}.....,,,..||||,}|{||||}}|))))).,,{{{(({{{||||{{{|{{..((((((((...)))))},)).....((.(((((((......))))))).)}.((({(((.(((((.......((((((..(((.(((..(((((....)))))..))).)))..)))))).....))))).)))..)))).((((((.....))))))(((((....))))).,},,....|||||,....},,|||,|||||.{{{,...)))),,.....(((((..(((((((..(({{{((.(((.....((.(((((((((((...((({,((,...,{....}}..}}})))).{{{.{,,((({((,,,,.........}))))),..}}}..........((((((...)))))).,{{{{||,,|,{{((((({(((,..,,{{{{||||..,,..,,..(((((((...........))))))).{{|||||||}||{,|}}}})),,,}))))},,,,,.}))))).))))).))....))).))))))..)))))))..)))))|{{|{((((({{.,.....,.,,.}}},.,,.,}))))),)))|{||||,,||||||||,|,|..((((((||(({..,,,{(((..(((.((({,,......,,....,,)))).)))..)))).,}},}},....))))))(((((((..{(.{((.((((......)))).)).}.}}.)))))))......(((.(((((((((((.....,,...((((........)))).))))))}..,)))))))))....}}}}}))})}},})),....}}})}},....(((((({{......)}.))))))..|||,||||..,.{{..,((({.,.|||||.,,,|||,..,,))}....))))).}))}}.}}.}..}|||.}}}||..,.((,,.,})|},}}})))))}}}}})},,|}|)|}}}}}},,,})}},)},},,}}}}}},}}.,))},,,}}||,,||||||},.,.,}}}},...,|||||},.{{||,,,,))}),,}})),)}......,,}}))))),,,}}},,},}}})}}},,,|}||}}},..,}}}}))),}|||...,)))}}|||||,}|}||})},}},}}}.....,}).)})))),.))))),.))(((((((.((((.((((......((.(((((.{{..((((,,,({.........)))).,)),))))).))..,..}))).)))).)))))))}||||||,.{||}|,.|||}}}},.,|.,.,,.}}}...,}}}}|(((((.{{.{({{.,,..}})},,)).))))))||||,,..})}}
Forensic Context

No forensic context available.