Basic Information

Symbol
hsa_PREX2_0008400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0084712 hsa_circPREX2_015 hsa-PREX2_0060
Host gene
PREX2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
8:68989632-69002950 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
8:68077397-68090715 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-179.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -193.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 208.71
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....((((((.............))))))......(((((((((..(((((.((....(((..((((((..(((((.......((((((.((((.(..(((.(((((((((.((((........)))).)))....))).))).)))..).))))...))).)))......(((((((....)))))))......(((((((((..(((.((((((........)))))).)))))))))))).........((((((........((((((..((((..(.((.((.((((.((..(((((.(((.((.(.(((((((..((((((........))))))))))......))).).)))))..))).))..)))))).)).)).)..))))(((((((....(((((....(((((((((...........((((....))))...((((((((.....(((((((.........)))).))).....))))))))(((((((....)))))))...))))))))))))))...))))))).))))))..(((((...))))).)))))).....))))))))))).)))...))..))))).)))))))))((((...(((((......))))).))))...((((...(((((.........)))))....))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
{..,...{|(,{...........,((((((((({{(((((({(,.((((((((((.({({(((({,((({.(((((,,,....{{((((.((((.,..(((.(((({{{{{.((((,,,,,...}}}}.)))},,,))),))).)))..}.))))...))).}}}.,....(((((((....)))))))......{{{{{((((,.(((,((((((,.......|}}}}}.}}|||||}))}),||{{{{,.{,,{{{........,,{{(({{(.,,..,}||}|{.{,,,,{{,.|||||.{|{,,{.|,||||(({.,((((((........)))))))))}},,,,,))),)},)))),.}}},)),.}}||||,,,{||{|..,,,)||||,||},,.|||||....(((((((((...{,,...{.{{{||||.)))}...((((((((.....(((({{(.........))},}))).....))))))))(((((((....)))))))...)))))))))|||||.{.||||,}|{||||||..(((((...)))))}))))))..)},)})}}))))},..,},.}}}}.,}})),))}.))))}.),.}))).),.)))))))))))))))).,.{{{{,,.{(({{..,,..,},)})))}}}.}}),..,
Forensic Context

No forensic context available.